RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605833.1

VIM-AS1-202, VIM antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene VIM-AS1, Length 918 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIM-AS1-202ENST00000605833 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa21.9■■□□□ 1.1
VIM-AS1-202ENST00000605833 FAM221BA6H8Z2 402 aa21.89■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 IKBKBO14920 756 aa21.89■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 CILPO75339 1184 aa21.89■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 RALAP11233 206 aa21.89■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 PPP3CAQ08209 521 aa21.89■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 SLC14A1Q13336 389 aa21.89■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF394Q53GI3 561 aa21.89■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.89■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 SORCS1Q8WY21 1168 aa21.89■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 IL21RQ9HBE5 538 aa21.89■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 CLEC4EQ9ULY5 219 aa21.89■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa21.89■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 PTPRBP23467 1997 aa21.88■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 A0A1B0GTW7 788 aa21.88■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 PRKCHP24723 683 aa21.88■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 PSEN1P49768 467 aa21.88■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 TPMTP51580 245 aa21.88■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 DCAF12L1Q5VU92 463 aa21.88■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 TADA2BQ86TJ2 420 aa21.88■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 PROSER1Q86XN7 944 aa21.88■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 DUSP16Q9BY84 665 aa21.88■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 CYP3A43Q9HB55 503 aa21.88■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 ADAMTS20P59510 1910 aa21.88■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 CALUO43852 315 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 SCAPQ12770 1279 aa21.87■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF234Q14588 700 aa21.87■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa21.87■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 TMPRSS6Q8IU80 811 aa21.87■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 DENND1CQ8IV53 801 aa21.87■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 DNASE2BQ8WZ79 361 aa21.87■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 CIPCQ9C0C6 399 aa21.87■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 GDPD2Q9HCC8 539 aa21.87■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 ITM2CQ9NQX7 267 aa21.87■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 CLIC5Q9NZA1 410 aa21.87■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF510Q9Y2H8 683 aa21.87■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 USP3Q9Y6I4 520 aa21.87■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 TMEM131Q92545 1883 aa21.87■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 NUMA1Q14980 2115 aa21.86■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 A0A1B0GVL5 298 aa21.86■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 CAPNS1P04632 268 aa21.86■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 PRR29P0C7W0 189 aa21.86■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 PFKFB1P16118 471 aa21.86■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 NR2F2P24468 414 aa21.86■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 CHKAP35790 457 aa21.86■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 COPAP53621 1224 aa21.86■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 COG7P83436 770 aa21.86■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 BNC1Q01954 994 aa21.86■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 ENPP2Q13822 863 aa21.86■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 FAM124AQ86V42 546 aa21.86■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 UCMAQ8WVF2 138 aa21.86■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa21.86■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 SIPA1Q96FS4 1042 aa21.86■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa21.86■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa21.86■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 SLC12A8A0AV02 714 aa21.85■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 TMEM215Q68D42 235 aa21.85■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 C19orf48Q6RUI8 117 aa21.85■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 SLCO6A1Q86UG4 719 aa21.85■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.85■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF276Q8N554 614 aa21.85■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 DCLK3Q9C098 648 aa21.85■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa21.85■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 ELOVL2Q9NXB9 296 aa21.85■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 MARCH2Q9P0N8 246 aa21.85■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa21.85■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa21.85■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa21.85■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.84■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 MAPK13O15264 365 aa21.84■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 CBFA2T3O75081 653 aa21.84■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 EPHX1P07099 455 aa21.84■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 KRT13P13646 458 aa21.84■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 HLA-EP13747 358 aa21.84■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 CLEC17AQ6ZS10 378 aa21.84■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 CADM4Q8NFZ8 388 aa21.84■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 DDI1Q8WTU0 396 aa21.84■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 SNX19Q92543 992 aa21.84■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 GBP4Q96PP9 640 aa21.84■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 ARID3AQ99856 593 aa21.84■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 GAREM1Q9H706 876 aa21.84■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 LOC400499M0QZD8 3231 aa21.84■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 METTL12A8MUP2 240 aa21.83■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 NPC1O15118 1278 aa21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms