RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC122Q5T0U0 273 aa34.47■■■■□ 3.11
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DENND1CQ8IV53 801 aa34.47■■■■□ 3.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 EMC1Q8N766 993 aa34.47■■■■□ 3.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 EPHX3Q9H6B9 360 aa34.47■■■■□ 3.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
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CTDNEP1-209ENST00000574205 JOSD2Q8TAC2 188 aa34.46■■■■□ 3.11
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LATS1O95835 1130 aa34.45■■■■□ 3.11
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa34.45■■■■□ 3.11
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MSANTD3Q96H12 275 aa34.45■■■■□ 3.1
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP34.45■■■■□ 3.1
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa34.44■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 DLL1O00548 723 aa34.44■■■■□ 3.1
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SDC4P31431 198 aa34.44■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHKAP35790 457 aa34.44■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 NME3Q13232 169 aa34.44■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAMLD1Q13495 774 aa34.44■■■■□ 3.1
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SHDQ96IW2 340 aa34.44■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 MCEEQ96PE7 176 aa34.44■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 COX16Q9P0S2 106 aa34.44■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 APOEP02649 317 aa34.43■■■■□ 3.1
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DHCR24Q15392 516 aa34.43■■■■□ 3.1
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CTDNEP1-209ENST00000574205 STOML2Q9UJZ1 356 aa34.43■■■■□ 3.1
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CTDNEP1-209ENST00000574205 STARD6P59095 220 aa34.4■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC14Q49A88 953 aa34.4■■■■□ 3.1
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