RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559850.5

RABGGTA-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-211ENST00000559850 GRIA2P42262 883 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 WASP42768 502 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 HARS2P49590 506 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF165P49910 485 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 SGSHP51688 502 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 TBX4P57082 545 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 DMC1Q14565 340 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 C2CD6Q53TS8 623 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 FYB2Q5VWT5 728 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 OR6B2Q6IFH4 312 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 TERB1Q8NA31 727 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 BPIFA3Q9BQP9 254 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 LHX5Q9H2C1 402 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 HCN2Q9UL51 889 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF510Q9Y2H8 683 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 PRRT4C9JH25 899 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 SGK1O00141 431 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 CAPN9O14815 690 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 HRO43593 1189 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 IGLV3-27P01718 113 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 CISD3P0C7P0 127 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 JAM2P57087 298 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 BPIFB4P59827 614 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 IQCB1Q15051 598 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 SYT13Q7L8C5 426 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 DEFB106AQ8N104 65 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 NEK11Q8NG66 645 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 EPS8L1Q8TE68 723 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 DDI1Q8WTU0 396 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 SYNCQ9H7C4 482 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-211ENST00000559850 DMDP11532 3685 aa15.46■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 VPS13AQ96RL7 3174 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 LRRC10BA6NIK2 292 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 SMTNL1A8MU46 457 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 SART1O43290 800 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 PENKP01210 267 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 LMNAP02545 664 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC6A4P31645 630 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 SOX5P35711 763 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 CHKAP35790 457 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 TNFRSF4P43489 277 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 DGKGP49619 791 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 NRLP54845 237 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 ARID5AQ03989 594 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 DCAF6Q58WW2 860 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 NADSYN1Q6IA69 706 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 RFWD3Q6PCD5 774 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 TMEM92Q6UXU6 159 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 PRR23BQ6ZRT6 265 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 LONP2Q86WA8 852 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 FAM217AQ8IXS0 508 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 CPXM2Q8N436 756 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 DCLK2Q8N568 766 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 IL17RCQ8NAC3 791 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 SUMF1Q8NBK3 374 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 TMEM35BQ8NCS4 154 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 ACDQ96AP0 544 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 MYEOVQ96EZ4 313 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 NOX5Q96PH1 765 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 SPAG5Q96R06 1193 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 ACOX2Q99424 681 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 POPDC2Q9HBU9 364 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 COX16Q9P0S2 106 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 CEP83Q9Y592 693 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 A0A0A0MRY4 1105 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 ADAM23O75077 832 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 CYBBP04839 570 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 CHRNB2P17787 502 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 GEN1Q17RS7 908 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 NAA35Q5VZE5 725 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 OLFML1Q6UWY5 402 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 LUZP1Q86V48 1076 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 CPA5Q8WXQ8 436 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 SERPINB11Q96P15 392 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 ERGIC2Q96RQ1 377 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 TPSD1Q9BZJ3 242 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 FAM204AQ9H8W3 233 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 CBX8Q9HC52 389 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 MMP17Q9ULZ9 603 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTA-211ENST00000559850 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms