RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 RPSAP08865 295 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ALADP13716 330 aa8.73□□□□□ -1.01
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PTPRB-208ENST00000550358 NOS2P35228 1153 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 GP5P40197 560 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 POLD2P49005 469 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 MAP2K5Q13163 448 aa8.73□□□□□ -1.01
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PTPRB-208ENST00000550358 REXO1L1PQ8IX06 675 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CLEC4FQ8N1N0 589 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC52Q8N7C0 313 aa8.73□□□□□ -1.01
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PTPRB-208ENST00000550358 CYLDQ9NQC7 956 aa8.73□□□□□ -1.01
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PTPRB-208ENST00000550358 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
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PTPRB-208ENST00000550358 MICAL2O94851 1124 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 FGRP09769 529 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ERVK-10P10266 1014 aa8.73□□□□□ -1.01
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PTPRB-208ENST00000550358 KRT78Q8N1N4 520 aa8.73□□□□□ -1.01
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PTPRB-208ENST00000550358 GPRC5DQ9NZD1 345 aa8.73□□□□□ -1.01
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PTPRB-208ENST00000550358 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
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PTPRB-208ENST00000550358 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.73□□□□□ -1.01
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PTPRB-208ENST00000550358 CBWD1Q9BRT8 395 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 TINF2Q9BSI4 451 aa8.73□□□□□ -1.01
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PTPRB-208ENST00000550358 FAM153AQ9UHL3 310 aa8.73□□□□□ -1.01
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PTPRB-208ENST00000550358 ZMYM5Q9UJ78 669 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa8.72□□□□□ -1.01
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PTPRB-208ENST00000550358 WNK4Q96J92 1243 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 C9orf72Q96LT7 481 aa8.72□□□□□ -1.01
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PTPRB-208ENST00000550358 SAC3D1A6NKF1 404 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF185O15231 689 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 IFNGR2P38484 337 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 VHLP40337 213 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 SGCGQ13326 291 aa8.72□□□□□ -1.01
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