RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 TAF2Q6P1X5 1199 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 KCNT2Q6UVM3 1135 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 SH2D5Q6ZV89 423 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 IGDCC3Q8IVU1 814 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 ARHGAP24Q8N264 748 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 TMEM86AQ8N2M4 240 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 CCDC110Q8TBZ0 833 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 ATP2A3Q93084 1043 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 NTAN1Q96AB6 310 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 TTC17Q96AE7 1141 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 FAM111AQ96PZ2 611 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 TRIM62Q9BVG3 475 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 AP5M1Q9H0R1 490 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 LRRC4Q9HBW1 653 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 NPHS2Q9NP85 383 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 GGT7Q9UJ14 662 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 FZD10Q9ULW2 581 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 GINS2Q9Y248 185 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 SCN4AP35499 1836 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 C17orf102A2RUQ5 167 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 SDR42E2A6NKP2 422 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 M0QZ92 97 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 HAS3O00219 553 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 PPEF2O14830 753 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 GLRA3O75311 464 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 ALDH1A2O94788 518 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 C1QAP02745 245 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 PGAM1P18669 254 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 CALB2P22676 271 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 MAP2K2P36507 400 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 GARSP41250 739 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 LHX1P48742 406 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 GBE1Q04446 702 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 ZBTB16Q05516 673 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 MAP2K5Q13163 448 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 GLRA4Q5JXX5 417 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 CHADLQ6NUI6 762 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 LRRC8BQ6P9F7 803 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 UNC5AQ6ZN44 842 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 TLK2Q86UE8 772 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 PIGZQ86VD9 579 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 FAM228AQ86W67 206 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 ZNF276Q8N554 614 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 SLC2A14Q8TDB8 520 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 RNF139Q8WU17 664 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 SPOCK2Q92563 424 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 SERAC1Q96JX3 654 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 SIGLEC10Q96LC7 697 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 SLC2A13Q96QE2 648 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 WWP1Q9H0M0 922 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 DPEP3Q9H4B8 488 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 TLE6Q9H808 572 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 EBF2Q9HAK2 575 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 MTMR10Q9NXD2 777 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 KCNK4Q9NYG8 393 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 DTLQ9NZJ0 730 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 IGSF9Q9P2J2 1179 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 SLC17A7Q9P2U7 560 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 STK38LQ9Y2H1 464 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 PLLPQ9Y342 182 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 NME7Q9Y5B8 376 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 USP3Q9Y6I4 520 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 CITO14578 2027 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 MCM3APO60318 1980 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 WDR91A4D1P6 747 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 C9IYK1 514 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 GOLGA8RI6L899 631 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 CCDC22O60826 627 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 FAM200BP0CF97 657 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 FGFR1P11362 822 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 MX2P20592 715 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 DNAJB2P25686 324 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 TARSP26639 723 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 HCAR3P49019 387 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 GJA9P57773 515 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 ADAM17P78536 824 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 ADIGQ0VDE8 80 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-205ENST00000546891 SCAPQ12770 1279 aa10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms