RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518681.5

MIB2-231, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene MIB2, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-231	ENST00000518681	PGBD4	Q96DM1	585 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	KIF12	Q96FN5	646 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	FZD8	Q9H461	694 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	TPP1	O14773	563 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	CIB2	O75838	187 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	TGDS	O95455	350 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	ANPEP	P15144	967 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	PDE1B	Q01064	536 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	PPP2R5D	Q14738	602 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681		Q3C1V9	767 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	RAPH1	Q70E73	1250 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	ILDR2	Q71H61	639 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	FAM131B	Q86XD5	332 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	TNS4	Q8IZW8	715 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	CCDC185	Q8N715	623 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	AGAP3	Q96P47	875 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	WWP1	Q9H0M0	922 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	SCOC	Q9UIL1	159 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	PSME4	Q14997	1843 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	BPGM	P07738	259 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF286B	P0CG31	522 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	KRT72	Q14CN4	511 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	LPCAT4	Q643R3	524 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	MOB2	Q70IA6	237 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	LCT	P09848	1927 aa		19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	VDR	P11473	427 aa		19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	MLH1	P40692	756 aa		19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	VGLL4	Q14135	290 aa		19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	SESTD1	Q86VW0	696 aa		19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	19.5	■□□□□ 0.71	4e-6	■■■■■ 36.6
MIB2-231	ENST00000518681	NME7	Q9Y5B8	376 aa		19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	ADCY6	O43306	1168 aa		19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	NPTXR	O95502	500 aa		19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	ERVK-10	P10266	1014 aa		19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	CCDC130	P13994	396 aa		19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	GOT1	P17174	413 aa		19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	MGAT1	P26572	445 aa		19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	AP1B1	Q10567	949 aa		19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	GRM1	Q13255	1194 aa		19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	LGSN	Q5TDP6	509 aa		19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	DPP3	Q9NY33	737 aa		19.5	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	ARRB2	P32121	409 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	OTUD5	Q96G74	571 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	AP1G2	O75843	785 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	ENDOD1	O94919	500 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	INSRR	P14616	1297 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	LBX2	Q6XYB7	198 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	CCNY	Q8ND76	341 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	CHST13	Q8NET6	341 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	CXorf38	Q8TB03	319 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	NLRP7	Q8WX94	980 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	C12orf42	Q96LP6	360 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	MCM3AP	O60318	1980 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	SAT1	P21673	171 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	USP4	Q13107	963 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	NDE1	Q9NXR1	346 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		19.49	■□□□□ 0.71

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