RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 LONP2Q86WA8 852 aa19.52■□□□□ 0.72
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SH3BP2-218ENST00000511185 IL17RCQ8NAC3 791 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP2-218ENST00000511185 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
SH3BP2-218ENST00000511185 DEC1Q9P2X7 70 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP2-218ENST00000511185 MMP17Q9ULZ9 603 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP2-218ENST00000511185 SIK3Q9Y2K2 1263 aa19.52■□□□□ 0.72
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SH3BP2-218ENST00000511185 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
SH3BP2-218ENST00000511185 FKBP15Q5T1M5 1219 aa19.48■□□□□ 0.71
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SH3BP2-218ENST00000511185 LHX5Q9H2C1 402 aa19.48■□□□□ 0.71
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SH3BP2-218ENST00000511185 SART1O43290 800 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
SH3BP2-218ENST00000511185 APBB3O95704 486 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLV3-25P01717 112 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP2-218ENST00000511185 MMEP08473 750 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP2-218ENST00000511185 TNFRSF4P43489 277 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP2-218ENST00000511185 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
SH3BP2-218ENST00000511185 C2CD6Q53TS8 623 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP2-218ENST00000511185 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
SH3BP2-218ENST00000511185 WFDC5Q8TCV5 224 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP2-218ENST00000511185 DDI1Q8WTU0 396 aa19.47■□□□□ 0.71
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