RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 TTC39CQ8N584 583 aa31.68■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 SLC4A11Q8NBS3 891 aa31.68■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 SEMA4DQ92854 862 aa31.68■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 DNAI2Q9GZS0 605 aa31.68■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 KRT13P13646 458 aa31.67■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 RPL13P26373 211 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 SYKP43405 635 aa31.67■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 NDUFA8P51970 172 aa31.67■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 SYCP2LQ5T4T6 812 aa31.67■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 CADM4Q8NFZ8 388 aa31.67■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 ERLEC1Q96DZ1 483 aa31.67■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa31.67■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 NDUFS2O75306 463 aa31.66■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 CAPNS1P04632 268 aa31.66■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 RAD23BP54727 409 aa31.66■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 ADAM9Q13443 819 aa31.66■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 WDR45BQ5MNZ6 344 aa31.66■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 PM20D1Q6GTS8 502 aa31.66■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 ARHGAP18Q8N392 663 aa31.66■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM176AQ96HP8 235 aa31.66■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 CISHQ9NSE2 258 aa31.66■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 RASAL2Q9UJF2 1139 aa31.66■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 KCNJ18B7U540 433 aa31.65■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 EFEMP1Q12805 493 aa31.65■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 STARD3Q14849 445 aa31.65■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF423Q2M1K9 1284 aa31.65■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 EDRF1Q3B7T1 1238 aa31.65■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 PLEKHG6Q3KR16 790 aa31.65■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF394Q53GI3 561 aa31.65■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 BHLHA9Q7RTU4 235 aa31.65■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 PIGZQ86VD9 579 aa31.65■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC150Q8NCX0 1101 aa31.65■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 SLC2A11Q9BYW1 496 aa31.65■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa31.65■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 CLEC4EQ9ULY5 219 aa31.65■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa31.65■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 DSPP15924 2871 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa31.64■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 RGL4Q8IZJ4 473 aa31.64■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 ANKRD52Q8NB46 1076 aa31.64■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 ELOVL2Q9NXB9 296 aa31.64■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 MARCH2Q9P0N8 246 aa31.64■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 ZDHHC9Q9Y397 364 aa31.64■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 ATRXP46100 2492 aa31.64■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 GNSP15586 552 aa31.63■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 COPAP53621 1224 aa31.63■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 E2F5Q15329 346 aa31.63■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM215Q68D42 235 aa31.63■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 FBXL13Q8NEE6 735 aa31.63■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 UCMAQ8WVF2 138 aa31.63■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 SPATA32Q96LK8 384 aa31.63■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 RAB20Q9NX57 234 aa31.63■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 MAOBP27338 520 aa31.62■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 TPMTP51580 245 aa31.62■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP31.62■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 GRIK2Q13002 908 aa31.62■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF234Q14588 700 aa31.62■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 KRBA2Q6ZNG9 492 aa31.62■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 TMPRSS6Q8IU80 811 aa31.62■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 DENND1CQ8IV53 801 aa31.62■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 KNL1Q8NG31 2342 aa31.62■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 ARID3AQ99856 593 aa31.62■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 MMRN2Q9H8L6 949 aa31.62■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 STOML2Q9UJZ1 356 aa31.62■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 LAMA5O15230 3695 aa31.62■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 A0A1B0GTW7 788 aa31.61■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 SH3BP5O60239 455 aa31.61■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 NCAM1P13591 858 aa31.61■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 OXTRP30559 389 aa31.61■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 RDXP35241 583 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 MXI1P50539 228 aa31.61■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa31.61■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 C1orf216Q8TAB5 229 aa31.61■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 PLD4Q96BZ4 506 aa31.61■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 CAMK1GQ96NX5 476 aa31.61■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 STRIP2Q9ULQ0 834 aa31.61■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 A0A1W2PQ27 194 aa31.6■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 A0A1W2PQ64 194 aa31.6■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 METTL12A8MUP2 240 aa31.6■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 TIMM44O43615 452 aa31.6■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 CBFA2T3O75081 653 aa31.6■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 HMBSP08397 361 aa31.6■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 KRT85P78386 507 aa31.6■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 COQ4Q9Y3A0 265 aa31.6■■■□□ 2.65
ALYREF-202ENST00000505490 ZBED1O96006 694 aa31.59■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms