RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	NAT1	P18440	290 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	GTF2H1	P32780	548 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	MLH1	P40692	756 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	MASP1	P48740	699 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	MXI1	P50539	228 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCNN1G	P51170	649 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	JAM2	P57087	298 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERVFC1	P60507	584 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TPM4	P67936	248 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEFB103A	P81534	67 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCZ1B	P86790	482 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	MVK	Q03426	396 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	MTF1	Q14872	753 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDXDC1	Q6P996	788 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	RRAGA	Q7L523	313 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDR49	Q8IV35	697 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	USP38	Q8NB14	1042 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	BAD	Q92934	168 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CASD1	Q96PB1	797 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHP1	Q99653	195 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	SYT11	Q9BT88	431 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ASB7	Q9H672	318 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACP6	Q9NPH0	428 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB20	Q9NX57	234 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYH11	P35749	1972 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	PIR	O00625	290 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	P4HA2	O15460	535 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	HCRT	O43612	131 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSPN	O60542	156 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	MFAP3L	O75121	409 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL18RAP	O95256	599 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	RASGRP1	O95267	797 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ASL	P04424	464 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ITGB1	P05556	798 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	MSL3P1	P0C860	447 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	SKIL	P12757	684 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	UCHL3	P15374	230 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNNI1	P19237	187 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	LSAMP	Q13449	338 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC142	Q17RM4	750 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	FIGN	Q5HY92	759 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRT39	Q6A163	491 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	MFSD5	Q6N075	450 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	GBP6	Q6ZN66	633 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF169	Q8NCN4	708 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	DPP3	Q9NY33	737 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	GCNT4	Q9P109	453 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266		X6R8D5	127 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ALPK3	Q96L96	1907 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PQJ5	194 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKRD62	A6NC57	917 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRC53	A6NM62	1247 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266		H7BY64	318 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF263	O14978	683 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	POMC	P01189	267 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ITGB3	P05106	788 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHRNB2	P17787	502 aa		6.56	□□□□□ -1.36

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