RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 UBXN1Q04323 297 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-214ENST00000490425 SYCP1Q15431 976 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-214ENST00000490425 LPAL2Q16609 132 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-214ENST00000490425 C10orf76Q5T2E6 689 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-214ENST00000490425 FYB2Q5VWT5 728 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-214ENST00000490425 SYT13Q7L8C5 426 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-214ENST00000490425 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
NISCH-214ENST00000490425 LONP2Q86WA8 852 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-214ENST00000490425 TERB1Q8NA31 727 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-214ENST00000490425 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
NISCH-214ENST00000490425 ACDQ96AP0 544 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-214ENST00000490425 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
NISCH-214ENST00000490425 STK33Q9BYT3 514 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-214ENST00000490425 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
NISCH-214ENST00000490425 LHX5Q9H2C1 402 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-214ENST00000490425 NLRC4Q9NPP4 1024 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-214ENST00000490425 SIK3Q9Y2K2 1263 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-214ENST00000490425 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
NISCH-214ENST00000490425 SGK1O00141 431 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 CAPN9O14815 690 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 GRAP2O75791 330 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 GFPT2O94808 682 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 ERBB2P04626 1255 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 CISD3P0C7P0 127 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 HOXA6P31267 233 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 CHKAP35790 457 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 DGKGP49619 791 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 TBX4P57082 545 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 KLHL40Q2TBA0 621 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 SYPL2Q5VXT5 272 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 PRR23BQ6ZRT6 265 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 TAC4Q86UU9 113 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 WDR5BQ86VZ2 330 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 CPXM2Q8N436 756 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 IL17RCQ8NAC3 791 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 CCDC26Q8TAB7 109 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 DDI1Q8WTU0 396 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 EPC1Q9H2F5 836 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 PDCL3Q9H2J4 239 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 HCN2Q9UL51 889 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 CLEC4EQ9ULY5 219 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 MMP17Q9ULZ9 603 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 SYCE3A1L190 88 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 PRRT4C9JH25 899 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 ADAM23O75077 832 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 APBB3O95704 486 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 PENKP01210 267 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 IGLV3-27P01718 113 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 CYBBP04839 570 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 WASP42768 502 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
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NISCH-214ENST00000490425 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 PTPN20Q4JDL3 420 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 SMYD5Q6GMV2 418 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 OR6B2Q6IFH4 312 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 TMEM92Q6UXU6 159 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 FAM217AQ8IXS0 508 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 DCLK2Q8N568 766 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 CAMKK1Q8N5S9 505 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 TSTD1Q8NFU3 115 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 SLC20A1Q8WUM9 679 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 NOX5Q96PH1 765 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 HINFPQ9BQA5 517 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 BPIFA3Q9BQP9 254 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 FUCA2Q9BTY2 467 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 SYNCQ9H7C4 482 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 POPDC2Q9HBU9 364 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 FBXO10Q9UK96 956 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 CEP83Q9Y592 693 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 LRRC10BA6NIK2 292 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 AXIN1O15169 862 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 TEX33O43247 280 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 MMEP08473 750 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 ZNF165P49910 485 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 SGSHP51688 502 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 JAM2P57087 298 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 RING1Q06587 406 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 CRY1Q16526 586 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 MPPE1Q53F39 396 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 C2CD6Q53TS8 623 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 DCAF6Q58WW2 860 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-214ENST00000490425 ADGRF1Q5T601 910 aa12.5□□□□□ -0.41
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