RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486660.1

STX4-209, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 610 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-209ENST00000486660 A8MXQ7 604 aa14.83□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 TSPAN3O60637 253 aa14.83□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 GCNT3O95395 438 aa14.83□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 SEMA4FO95754 770 aa14.83□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 C1SP09871 688 aa14.83□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 CD27P26842 260 aa14.83□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 SHBQ15464 509 aa14.83□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 RILPL1Q5EBL4 403 aa14.83□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 FYB2Q5VWT5 728 aa14.83□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 MCTP1Q6DN14 999 aa14.83□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 SYCP3Q8IZU3 236 aa14.83□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 GPD1LQ8N335 351 aa14.83□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 AK8Q96MA6 479 aa14.83□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 LHX5Q9H2C1 402 aa14.83□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 CLEC4EQ9ULY5 219 aa14.83□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 NPC1O15118 1278 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 SLC26A4O43511 780 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 AP1G2O75843 785 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 BEST1O76090 585 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 PENKP01210 267 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 ITGAVP06756 1048 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 CDK4P11802 303 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 ABCB4P21439 1286 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 GLDCP23378 1020 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 C21orf59P57076 290 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 TMPRSS3P57727 454 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 WDR72Q3MJ13 1102 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 PKDCCQ504Y2 493 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 TMEM215Q68D42 235 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 CBWD2Q8IUF1 395 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 ZNF366Q8N895 744 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 OR2T3Q8NH03 318 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 SAP25Q8TEE9 199 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 UCMAQ8WVF2 138 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 TSC1Q92574 1164 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 TTC9Q92623 222 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 SNX21Q969T3 373 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 SLC6A18Q96N87 628 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 CIPCQ9C0C6 399 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 ELOVL2Q9NXB9 296 aa14.82□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 H3BQV1 296 aa14.81□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 CYP26A1O43174 497 aa14.81□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 DFNA5O60443 496 aa14.81□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 KLKB1P03952 638 aa14.81□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 WNT1P04628 370 aa14.81□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 IGHV4-34P06331 123 aa14.81□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 TNNC1P63316 161 aa14.81□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 GOLGA8FQ08AF8 430 aa14.81□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa14.81□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa14.81□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa14.81□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 HSCBQ8IWL3 235 aa14.81□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 ZNF248Q8NDW4 579 aa14.81□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 SMOQ99835 787 aa14.81□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 TRIM4Q9C037 500 aa14.81□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 BTBD1Q9H0C5 482 aa14.81□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 KRT82Q9NSB4 513 aa14.81□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 ATP8B3O60423 1300 aa14.81□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 VILLO15195 856 aa14.8□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 STC2O76061 302 aa14.8□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 BCAT1P54687 386 aa14.8□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 BROXQ5VW32 411 aa14.8□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.8□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa14.8□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 WDR49Q8IV35 697 aa14.8□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 FUKQ8N0W3 1084 aa14.8□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.8□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.8□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 SMYD3Q9H7B4 428 aa14.8□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 NMUR1Q9HB89 426 aa14.8□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 CYLDQ9NQC7 956 aa14.8□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 COMMD8Q9NX08 183 aa14.8□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 SEL1LQ9UBV2 794 aa14.8□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.8□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa14.8□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 ZNF233A6NK53 670 aa14.79□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 CCDC130P13994 396 aa14.79□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 PDCP20941 246 aa14.79□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 CSRP3P50461 194 aa14.79□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 MAP3K7CLP57077 242 aa14.79□□□□□ -0.04
STX4-209ENST00000486660 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms