RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 DCLK3Q9C098 648 aa23.74■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa23.74■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 TMEM8AQ9HCN3 771 aa23.74■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 ITM2CQ9NQX7 267 aa23.74■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 GNSP15586 552 aa23.73■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 RDXP35241 583 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 IL12RB1P42701 662 aa23.73■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 ZNF132P52740 706 aa23.73■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 ADAM9Q13443 819 aa23.73■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 DNASE2BQ8WZ79 361 aa23.73■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 SEMA4DQ92854 862 aa23.73■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 UBXN6Q9BZV1 441 aa23.73■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 DNAI2Q9GZS0 605 aa23.73■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 CLEC4EQ9ULY5 219 aa23.73■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 ITPR1Q14643 2758 aa23.73■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 NBEAQ8NFP9 2946 aa23.73■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 BAHCC1Q9P281 2608 aa23.72■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 KCNJ18B7U540 433 aa23.72■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 RPL13P26373 211 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 ZNF423Q2M1K9 1284 aa23.72■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 DENND1CQ8IV53 801 aa23.72■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 SLC4A11Q8NBS3 891 aa23.72■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.72■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa23.72■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 KNL1Q8NG31 2342 aa23.71■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 GTF2H1P32780 548 aa23.71■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 SYKP43405 635 aa23.71■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 NDUFA8P51970 172 aa23.71■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 RAD23BP54727 409 aa23.71■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 DPYDQ12882 1025 aa23.71■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 GRIK2Q13002 908 aa23.71■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 RAB41Q5JT25 222 aa23.71■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 KRT39Q6A163 491 aa23.71■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 PIGZQ86VD9 579 aa23.71■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 TMPRSS6Q8IU80 811 aa23.71■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.71■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 CADM4Q8NFZ8 388 aa23.71■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 GPR174Q9BXC1 333 aa23.71■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 CISHQ9NSE2 258 aa23.71■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 ELOVL2Q9NXB9 296 aa23.71■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 MARCH2Q9P0N8 246 aa23.71■■□□□ 1.39
USP4-208ENST00000464168 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa23.7■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 NCAM1P13591 858 aa23.7■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 TPMTP51580 245 aa23.7■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 ZNF234Q14588 700 aa23.7■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 ZCWPW2Q504Y3 356 aa23.7■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa23.7■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 ARHGAP18Q8N392 663 aa23.7■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 CPXM2Q8N436 756 aa23.7■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 UCMAQ8WVF2 138 aa23.7■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 SIPA1Q96FS4 1042 aa23.7■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 TMEM176AQ96HP8 235 aa23.7■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 FAXDC2Q96IV6 333 aa23.7■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa23.7■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 STRIP2Q9ULQ0 834 aa23.7■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 LAMA5O15230 3695 aa23.7■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 A0A1B0GTW7 788 aa23.69■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 SLC12A8A0AV02 714 aa23.69■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 CYBBP04839 570 aa23.69■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 TMEM215Q68D42 235 aa23.69■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 ARHGAP17Q68EM7 881 aa23.69■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 NAXDQ8IW45 347 aa23.69■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 FAM217AQ8IXS0 508 aa23.69■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 TTC39CQ8N584 583 aa23.69■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 ANKRD52Q8NB46 1076 aa23.69■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 SORCS1Q8WY21 1168 aa23.69■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 SPATA32Q96LK8 384 aa23.69■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 ARID3AQ99856 593 aa23.69■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 SLC2A11Q9BYW1 496 aa23.69■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 MEI4A8MW99 385 aa23.68■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 IGLV3-19P01714 112 aa23.68■■□□□ 1.38
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USP4-208ENST00000464168 PRKCHP24723 683 aa23.68■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 OXTRP30559 389 aa23.68■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 COPAP53621 1224 aa23.68■■□□□ 1.38
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USP4-208ENST00000464168 PM20D1Q6GTS8 502 aa23.68■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 FBXL13Q8NEE6 735 aa23.68■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 DDI1Q8WTU0 396 aa23.68■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 TATDN2Q93075 761 aa23.68■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 EEF2KMTQ96G04 330 aa23.68■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 RAB20Q9NX57 234 aa23.68■■□□□ 1.38
USP4-208ENST00000464168 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa23.68■■□□□ 1.38
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