RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 ZBTB44Q8NCP5 570 aa21.62■■□□□ 1.05
VARS-218ENST00000459667 USP33Q8TEY7 942 aa21.62■■□□□ 1.05
VARS-218ENST00000459667 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.62■■□□□ 1.05
VARS-218ENST00000459667 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
VARS-218ENST00000459667 PLK2Q9NYY3 685 aa21.62■■□□□ 1.05
VARS-218ENST00000459667 SLC8A2Q9UPR5 921 aa21.62■■□□□ 1.05
VARS-218ENST00000459667 A0A0A0MRY4 1105 aa21.61■■□□□ 1.05
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VARS-218ENST00000459667 PENKP01210 267 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
VARS-218ENST00000459667 MMEP08473 750 aa21.61■■□□□ 1.05
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VARS-218ENST00000459667 FILIP1LQ4L180 1135 aa21.61■■□□□ 1.05
VARS-218ENST00000459667 C2orf27AQ580R0 203 aa21.61■■□□□ 1.05
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VARS-218ENST00000459667 SYPL2Q5VXT5 272 aa21.61■■□□□ 1.05
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VARS-218ENST00000459667 TAC4Q86UU9 113 aa21.61■■□□□ 1.05
VARS-218ENST00000459667 TERB1Q8NA31 727 aa21.61■■□□□ 1.05
VARS-218ENST00000459667 ADAM32Q8TC27 787 aa21.61■■□□□ 1.05
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VARS-218ENST00000459667 TEX33O43247 280 aa21.6■■□□□ 1.05
VARS-218ENST00000459667 LSM8O95777 96 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
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VARS-218ENST00000459667 DGKGP49619 791 aa21.6■■□□□ 1.05
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VARS-218ENST00000459667 C10orf76Q5T2E6 689 aa21.6■■□□□ 1.05
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VARS-218ENST00000459667 OLFML1Q6UWY5 402 aa21.6■■□□□ 1.05
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VARS-218ENST00000459667 ZNF677Q86XU0 584 aa21.6■■□□□ 1.05
VARS-218ENST00000459667 UNC45BQ8IWX7 931 aa21.6■■□□□ 1.05
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VARS-218ENST00000459667 P2RY11Q96G91 374 aa21.6■■□□□ 1.05
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VARS-218ENST00000459667 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
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VARS-218ENST00000459667 TLR6Q9Y2C9 796 aa21.6■■□□□ 1.05
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VARS-218ENST00000459667 ZNF445P59923 1031 aa21.58■■□□□ 1.05
VARS-218ENST00000459667 NOMO3P69849 1222 aa21.58■■□□□ 1.05
VARS-218ENST00000459667 CDR2Q01850 454 aa21.58■■□□□ 1.05
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VARS-218ENST00000459667 ADGRF1Q5T601 910 aa21.58■■□□□ 1.05
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VARS-218ENST00000459667 ASCL5Q7RTU5 278 aa21.58■■□□□ 1.05
VARS-218ENST00000459667 ERICH1Q86X53 443 aa21.58■■□□□ 1.05
VARS-218ENST00000459667 DEFB106AQ8N104 65 aa21.58■■□□□ 1.05
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VARS-218ENST00000459667 NAA35Q5VZE5 725 aa21.57■■□□□ 1.04
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