RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434481.1

USP9YP3-201, Transcript of USP9Y pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP3, Length 1,766 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP3-201ENST00000434481 NCDNQ9UBB6 729 aa7.86□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 DNAJB11Q9UBS4 358 aa7.86□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 NFU1Q9UMS0 254 aa7.86□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 PEAK1Q9H792 1746 aa7.86□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 PIK3C2AO00443 1686 aa7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 DCLK1O15075 740 aa7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 PJA2O43164 708 aa7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 GUCY1B2O75343 617 aa7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 POMCP01189 267 aa7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 UBL4AP11441 157 aa7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 DCTN1Q14203 1278 aa7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 CSHL1Q14406 222 aa7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 RASGRP2Q7LDG7 609 aa7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 METTL6Q8TCB7 284 aa7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 BPIFB1Q8TDL5 484 aa7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 FEM1CQ96JP0 617 aa7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 PWWP2AQ96N64 755 aa7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 ADPGKQ9BRR6 497 aa7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 RGPD1P0DJD0 1748 aa7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 PASKQ96RG2 1323 aa7.85□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 AGAP14A8MT82 685 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 PTGES3LE9PB15 166 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 SRGAP2O75044 1071 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 PGM3O95394 542 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 LARGE1O95461 756 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 CER1O95813 267 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 RGS2P41220 211 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 HARS2P49590 506 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 CLRN1P58418 232 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 CAMK1Q14012 370 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 UBXN2BQ14CS0 331 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 ACAP1Q15027 740 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 TBCCQ15814 346 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 GAGE13Q4V321 117 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 KDELC2Q7Z4H8 507 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 KYQ8NBH2 561 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 PLEKHA2Q9HB19 425 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 VEZTQ9HBM0 779 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 PEX12O00623 359 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 VILLO15195 856 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 SEPT4O43236 478 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 ADAM23O75077 832 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 LRMPQ12912 555 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 TDGQ13569 410 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 LIPMQ5VYY2 423 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 TRABD2AQ86V40 505 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 TAGAPQ8N103 731 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 ANKRD44Q8N8A2 993 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 C8orf58Q8NAV2 365 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 LINS1Q8NG48 757 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 ETNPPLQ8TBG4 499 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 SPATA17Q96L03 361 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 ENKD1Q9H0I2 346 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 SLC6A17Q9H1V8 727 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 SLC6A15Q9H2J7 730 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 ZWILCHQ9H900 591 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 TMLHEQ9NVH6 421 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 BAG5Q9UL15 447 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.84□□□□□ -1.15
USP9YP3-201ENST00000434481 IGSF1Q8N6C5 1336 aa7.83□□□□□ -1.16
USP9YP3-201ENST00000434481 USP54Q70EL1 1684 aa7.83□□□□□ -1.16
USP9YP3-201ENST00000434481 CHL1O00533 1208 aa7.83□□□□□ -1.16
USP9YP3-201ENST00000434481 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
USP9YP3-201ENST00000434481 TSPAN4O14817 238 aa7.83□□□□□ -1.16
USP9YP3-201ENST00000434481 BEST1O76090 585 aa7.83□□□□□ -1.16
USP9YP3-201ENST00000434481 LMNAP02545 664 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
USP9YP3-201ENST00000434481 PRNPP04156 253 aa7.83□□□□□ -1.16
USP9YP3-201ENST00000434481 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
USP9YP3-201ENST00000434481 NR2F1P10589 423 aa7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms