RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420234.5

PUM2-205, Transcript of pumilio RNA binding family member 2, human

TSL 5

Gene PUM2, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM2-205	ENST00000420234	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	ZNF677	Q86XU0	584 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	EFHB	Q8N7U6	833 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	STKLD1	Q8NE28	680 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	SLC35C1	Q96A29	364 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	MED10	Q9BTT4	135 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	GPR88	Q9GZN0	384 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	CHST7	Q9NS84	486 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	FANCL	Q9NW38	375 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	COMMD8	Q9NX08	183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	MIOS	Q9NXC5	875 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	MTRR	Q9UBK8	725 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	PPT2	Q9UMR5	302 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	NR2E1	Q9Y466	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	TRIP11	Q15643	1979 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PUM2-205	ENST00000420234	LCHN	A4D1U4	455 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	TISP43	B9A030	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	CYP26A1	O43174	497 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	CREB3	O43889	395 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	EDN1	P05305	212 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	POU2F2	P09086	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	CSH1	P0DML2	217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	CSH2	P0DML3	217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	VDR	P11473	427 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	KRT5	P13647	590 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	MYOG	P15173	224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62	1e-7	■■□□□ 11.8
PUM2-205	ENST00000420234	KRT9	P35527	623 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	STAT1	P42224	750 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	GATM	P50440	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	MYL6	P60660	151 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	GPR17	Q13304	367 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	CUL2	Q13617	745 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	KRT31	Q15323	416 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	PTPN14	Q15678	1187 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	NAB2	Q15742	525 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	DUSP6	Q16828	381 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	FIGN	Q5HY92	759 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	E2F7	Q96AV8	911 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	VWCE	Q96DN2	955 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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