RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 ECSITQ9BQ95 431 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 SLITRK3O94933 977 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 MPP3Q13368 585 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 SLC25A41Q8N5S1 370 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 PHC3Q8NDX5 983 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 MORF4L1Q9UBU8 362 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 PCYOX1Q9UHG3 505 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 XYLBO75191 536 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 IGSF6O95976 241 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 PSEN2P49810 448 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 TWF1Q12792 350 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 XRCC4Q13426 336 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 GRM3Q14832 879 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 DACT2Q5SW24 774 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 USP49Q70CQ1 688 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 SETD9Q8NE22 299 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 RIC1Q4ADV7 1423 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 NRCAMQ92823 1304 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF862O60290 1169 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 ASGR1P07306 291 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 TMPRSS6Q8IU80 811 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 P3H2Q8IVL5 708 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 OR56A4Q8NGH8 313 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 AGAP3Q96P47 875 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 KLHL4Q9C0H6 718 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 TMCC3Q9ULS5 477 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 C2CD2Q9Y426 696 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 AKAP3O75969 853 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 GLI1P08151 1106 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 PCYT1AP49585 367 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 RXFP2Q8WXD0 754 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 POPDC2Q9HBU9 364 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 WDR70Q9NW82 654 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 KCNK4Q9NYG8 393 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM216Q9P0N5 145 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 CDH9Q9ULB4 789 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 A0A088AWK7 358 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 SIGLEC16A6NMB1 481 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 MICAL2O94851 1124 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 ALDH2P05091 517 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 OR56A5P0C7T3 313 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 PRMT2P55345 433 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 ST3GAL1Q11201 340 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 LRRC34Q8IZ02 419 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 KIAA0895Q8NCT3 520 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 HTR3CQ8WXA8 447 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 THTPAQ9BU02 230 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 FICDQ9BVA6 458 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 AK9Q5TCS8 1911 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 SERPINF2P08697 491 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 PPP3CCP48454 512 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 TBX4P57082 545 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 RHOAP61586 193 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC149Q6ZUS6 474 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 SV2AQ7L0J3 742 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 ADNPQ9H2P0 1102 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 TRIM10Q9UDY6 481 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 DOLKQ9UPQ8 538 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 GOLGA8RI6L899 631 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 BIRC5O15392 142 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 SERPINB5P36952 375 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 IFNGR2P38484 337 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 TKTL1P51854 596 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 RAD23AP54725 363 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 GYS2P54840 703 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 ANKS6Q68DC2 871 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 ACTRT2Q8TDY3 377 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 TRPC4APQ8TEL6 797 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 ABHD8Q96I13 439 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 CNDP1Q96KN2 507 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 UGT2B28Q9BY64 529 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms