RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640499.1

VEGFA-231, Transcript of vascular endothelial growth factor A, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VEGFA, Length 1,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VEGFA-231	ENST00000640499	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		27.88	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		27.88	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	C12orf40	Q86WS4	652 aa		27.88	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		27.88	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		27.88	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	IGLV3-27	P01718	113 aa		27.87	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		27.87	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		27.87	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	TCF15	Q12870	199 aa		27.87	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	NOX5	Q96PH1	765 aa		27.87	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	SYT11	Q9BT88	431 aa		27.87	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		27.87	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	CEP83	Q9Y592	693 aa		27.87	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	ANTXRL	A6NF34	631 aa		27.86	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	LRRC53	A6NM62	1247 aa		27.86	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	SLC6A3	Q01959	620 aa		27.86	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	NR1H3	Q13133	447 aa		27.86	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		27.86	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	PLD4	Q96BZ4	506 aa		27.86	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		27.86	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		27.86	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		27.86	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		27.86	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	MYO6	Q9UM54	1294 aa		27.86	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		27.86	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		27.85	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	GRAP2	O75791	330 aa		27.85	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	IGLV3-25	P01717	112 aa		27.85	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	ADH5	P11766	374 aa		27.85	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	NUBP1	P53384	320 aa		27.85	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	FIGN	Q5HY92	759 aa		27.85	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	TAC4	Q86UU9	113 aa		27.85	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	XYLT1	Q86Y38	959 aa		27.85	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	DENND1C	Q8IV53	801 aa		27.85	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		27.85	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	DEFB106A	Q8N104	65 aa		27.85	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	ADAM32	Q8TC27	787 aa		27.85	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	GOLGA1	Q92805	767 aa		27.85	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	EGF	P01133	1207 aa		27.84	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	GLI1	P08151	1106 aa		27.84	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		27.84	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499		Q6ZS52	159 aa		27.84	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		27.84	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	ERICH1	Q86X53	443 aa		27.84	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		27.84	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		27.84	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		27.84	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	CD101	Q93033	1021 aa		27.84	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	C18orf8	Q96DM3	657 aa		27.84	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	SLC39A13	Q96H72	371 aa		27.84	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	AGPAT1	Q99943	283 aa		27.84	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		27.84	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	DCLK3	Q9C098	648 aa		27.84	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	CHRD	Q9H2X0	955 aa		27.84	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	GFRA2	O00451	464 aa		27.83	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	NCAM2	O15394	837 aa		27.83	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	ADH1C	P00326	375 aa		27.83	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	FER	P16591	822 aa		27.83	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	AMPD2	Q01433	879 aa		27.83	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	GAD2	Q05329	585 aa		27.83	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	PTP4A2	Q12974	167 aa		27.83	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		27.83	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		27.83	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		27.83	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	MARK1	Q9P0L2	795 aa		27.83	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		27.83	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		27.83	■■■□□ 2.05
VEGFA-231	ENST00000640499	HSF2BP	O75031	334 aa		27.82	■■■□□ 2.04
VEGFA-231	ENST00000640499	MMP8	P22894	467 aa		27.82	■■■□□ 2.04
VEGFA-231	ENST00000640499	MTAP	Q13126	283 aa		27.82	■■■□□ 2.04
VEGFA-231	ENST00000640499	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		27.82	■■■□□ 2.04
VEGFA-231	ENST00000640499	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		27.82	■■■□□ 2.04
VEGFA-231	ENST00000640499	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
VEGFA-231	ENST00000640499	SYNC	Q9H7C4	482 aa		27.82	■■■□□ 2.04
VEGFA-231	ENST00000640499	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		27.82	■■■□□ 2.04
VEGFA-231	ENST00000640499	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		27.82	■■■□□ 2.04
VEGFA-231	ENST00000640499	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		27.82	■■■□□ 2.04
VEGFA-231	ENST00000640499	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		27.82	■■■□□ 2.04
VEGFA-231	ENST00000640499	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		27.81	■■■□□ 2.04
VEGFA-231	ENST00000640499	TRIM24	O15164	1050 aa		27.81	■■■□□ 2.04
VEGFA-231	ENST00000640499	AP5Z1	O43299	807 aa		27.81	■■■□□ 2.04
VEGFA-231	ENST00000640499	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
VEGFA-231	ENST00000640499	TBX4	P57082	545 aa		27.81	■■■□□ 2.04
VEGFA-231	ENST00000640499	RING1	Q06587	406 aa		27.81	■■■□□ 2.04
VEGFA-231	ENST00000640499	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	27.81	■■■□□ 2.04

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