RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 NNTQ13423 1086 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 TADA2BQ86TJ2 420 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 TAC4Q86UU9 113 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRN4CLQ8ND94 238 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMG2Q969U7 264 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 FZD10Q9ULW2 581 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 H0YGN5 161 aa32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 IRAK2O43187 625 aa32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 TJP3O95049 919 aa32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 CDH6P55285 790 aa32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 SCAPQ12770 1279 aa32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM131BQ86XD5 332 aa32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 HOMER3Q9NSC5 361 aa32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHL11Q9NVR0 708 aa32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 AP4E1Q9UPM8 1137 aa32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 HIDE1A8MVS5 230 aa32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 PI4K2BG5E9Z4 385 aa32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 C2orf54Q08AI8 447 aa32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 CAMK1Q14012 370 aa32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 BRMS1LQ5PSV4 323 aa32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC70Q6NSX1 233 aa32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 KREMEN2Q8NCW0 462 aa32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 OSER1Q9NX31 292 aa32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 RARGP13631 454 aa32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT81Q14533 505 aa32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 SPRED2Q7Z698 418 aa32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF670Q9BS34 389 aa32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 WDCPQ9H6R7 721 aa32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 LRG1P02750 347 aa32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ADRA1BP35368 520 aa32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 PGFP49763 221 aa32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 CLCN4P51793 760 aa32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 EFHC2Q5JST6 749 aa32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC185Q8N715 623 aa32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAM32Q8TC27 787 aa32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 HDAC7Q8WUI4 952 aa32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 AP1M1Q9BXS5 423 aa32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 DPP7Q9UHL4 492 aa32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 PBX2P40425 430 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 TUBP50607 506 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 DPYSL3Q14195 570 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP2R5DQ14738 602 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP1B1Q16678 543 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX35Q5T0J7 233 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP2R2DQ66LE6 453 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 CASP10Q92851 521 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 RUNDC3BQ96NL0 473 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 CALN1Q9BXU9 219 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDH18Q9HCL0 1135 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 COX16Q9P0S2 106 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 TLR6Q9Y2C9 796 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 C8AP07357 584 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC2A3P11169 496 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 L1CAMP32004 1257 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHDC10Q6PID8 442 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 TDHQ8IZJ6 230 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ELMOD1Q8N336 334 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC28A3Q9HAS3 691 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 UQCRHLA0A096LP55 91 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 UQCRHP07919 91 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 CCR1P32246 355 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 MTA1Q13330 715 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 TFDP2Q14188 446 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 FAF2Q96CS3 445 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 MYO7AQ13402 2215 aa32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 PHF2O75151 1096 aa32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 CHRNA3P32297 505 aa32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 BBS12Q6ZW61 710 aa32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC13Q8NBP0 860 aa32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF34Q969K3 372 aa32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 HEMGNQ9BXL5 484 aa32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa32.22■■■□□ 2.75
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