RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538333.3

LIMK1-208, Transcript of LIM domain kinase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LIMK1, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1-208ENST00000538333 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 MGAT5Q09328 741 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 DNAJC3Q13217 504 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 KCNT2Q6UVM3 1135 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF534Q76KX8 674 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 BANPQ8N9N5 519 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 OLFM3Q96PB7 478 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 PITPNM3Q9BZ71 974 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 CACNG4Q9UBN1 327 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 TTLL3Q9Y4R7 772 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 CDY2AQ9Y6F7 541 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 UBOX5O94941 541 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 AMPD1P23109 780 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 SULT1E1P49888 294 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 RNF43Q68DV7 783 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 LVRNQ6Q4G3 990 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 FAM47EQ6ZV65 393 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 SH2D5Q6ZV89 423 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 FAM131BQ86XD5 332 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 IFNL1Q8IU54 200 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF276Q8N554 614 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 RMDN2Q96LZ7 410 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 NPY6RQ99463 290 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 STARD13Q9Y3M8 1113 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMK1-208ENST00000538333 DGKIO75912 1065 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 TPSB2P20231 275 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 CTGFP29279 349 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 NOS2P35228 1153 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 NDUFV1P49821 464 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 PTK7Q13308 1070 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 TPSAB1Q15661 275 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 WNT8BQ93098 351 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 FAM149B1Q96BN6 582 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 SLC2A13Q96QE2 648 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 CRTAC1Q9NQ79 661 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 FAM105AQ9NUU6 356 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 HAUS2Q9NVX0 235 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 GGT7Q9UJ14 662 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 TM9SF1O15321 606 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 EDF1O60869 148 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 VAV1P15498 845 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 SLC8A3P57103 927 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 DCAF6Q58WW2 860 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 VPS52Q8N1B4 723 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 FITM2Q8N6M3 262 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 LRRC39Q96DD0 335 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 SENP8Q96LD8 212 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 ARHGEF4Q9NR80 690 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 PHTF1Q9UMS5 762 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 TRPV2Q9Y5S1 764 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 RARBP10826 455 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 PRKCHP24723 683 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 ADRA1DP25100 572 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 ARL4AP40617 200 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 MLH1P40692 756 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 FAAP100Q0VG06 881 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 SEMA5AQ13591 1074 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 HHATQ5VTY9 493 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 TCP10LQ8TDR4 215 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 CFAP36Q96G28 342 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 SERAC1Q96JX3 654 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 SLC38A7Q9NVC3 462 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 MIOSQ9NXC5 875 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 KLHL14Q9P2G3 628 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 HACD1B0YJ81 288 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 GOLGA8RI6L899 631 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms