RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	NCR1	O76036	304 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	NDUFA10	O95299	355 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ITGB3	P05106	788 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	CFI	P05156	583 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ELANE	P08246	267 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	KCNA3	P22001	575 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	POLE2	P56282	527 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	CCNI	Q14094	377 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ICAM4	Q14773	271 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	EDA	Q92838	391 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	PALLD	Q8WX93	1383 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089		A0A1W2PS29	197 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	HMX3	A6NHT5	357 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089		M0R3H8	397 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	KCNQ3	O43525	872 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	VIP	P01282	170 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	HGF	P14210	728 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	NPPB	P16860	134 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ADORA2A	P29274	412 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	AKT1	P31749	480 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	PDE6C	P51160	858 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	PGD	P52209	483 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ARL4C	P56559	192 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	FSTL1	Q12841	308 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF384	Q8TF68	577 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	COG3	Q96JB2	828 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089		A0A1W2PP64	1363 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	FLT4	P35916	1363 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	MEGF6	O75095	1541 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089		K7ESM1	405 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	MUSK	O15146	869 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MDM2-223	ENST00000536089	CDKL5	O76039	1030 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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