RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526865.5

RRM1-204, Transcript of ribonucleotide reductase catalytic subunit M1, human

TSL 4

Gene RRM1, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM1-204	ENST00000526865	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	EXOC1	Q9NV70	894 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	DPP3	Q9NY33	737 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	USP25	Q9UHP3	1055 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	KNTC1	P50748	2209 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865		A0A1W2PQ27	194 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865		A0A1W2PQ64	194 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865		A0A1W2PQD8	194 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865		H3BRJ5	948 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865		H7C4K7	107 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	PRRG1	O14668	218 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	PPEF2	O14830	753 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	EXOC3	O60645	756 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	PHACTR2	O75167	634 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	IL18RAP	O95256	599 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	NFIC	P08651	508 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	DRD1	P21728	446 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	GART	P22102	1010 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	HOXD13	P35453	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	MAPK8	P45983	427 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	DGKE	P52429	567 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	BFSP1	Q12934	665 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	STK4	Q13043	487 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ORC1	Q13415	861 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	SERINC3	Q13530	473 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ALCAM	Q13740	583 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	PON2	Q15165	354 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ZBTB6	Q15916	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ARTN	Q5T4W7	220 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	SYT13	Q7L8C5	426 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	GLRX5	Q86SX6	157 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	CD302	Q8IX05	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	SHISA5	Q8N114	240 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	SPATA18	Q8TC71	538 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	SPACA7	Q96KW9	195 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	SENP8	Q96LD8	212 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	TMEM209	Q96SK2	561 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	STRA6	Q9BX79	667 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ASB7	Q9H672	318 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	OBP2A	Q9NY56	170 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	CREBBP	Q92793	2442 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		4.62	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms