RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497377.5

HLA-B-254, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, human

Gene HLA-B, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HLA-B-254	ENST00000497377	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	EFEMP1	Q12805	493 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	LRRC32	Q14392	662 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	MIB1	Q86YT6	1006 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	PLD4	Q96BZ4	506 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	MIS12	Q9H081	205 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	MYO6	Q9UM54	1294 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377		E5RJQ4	531 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	MDM4	O15151	490 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	EPHB6	O15197	1021 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	GFPT2	O94808	682 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	CYP17A1	P05093	508 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	GLI1	P08151	1106 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	IRF1	P10914	325 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	GJA4	P35212	333 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	SOX9	P48436	509 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	DHCR24	Q15392	516 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377		Q6ZNB5	142 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	PASD1	Q8IV76	773 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	TTC8	Q8TAM2	541 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	CPXM1	Q96SM3	734 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	TSPY26P	Q9H489	355 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	COL4A3	Q01955	1670 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	SLC12A8	A0AV02	714 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	PIK3R2	O00459	728 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	TEX33	O43247	280 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	GREM1	O60565	184 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	LATS1	O95835	1130 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	CHRNB1	P11230	501 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	ADH5	P11766	374 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	NCAM1	P13591	858 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	DRD1	P21728	446 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	CHKA	P35790	457 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	FANCC	Q00597	558 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	CDR2	Q01850	454 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	GAD2	Q05329	585 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	RING1	Q06587	406 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	NNT	Q13423	1086 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	FZD5	Q13467	585 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	NR1I3	Q14994	352 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	PON2	Q15165	354 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	FBXO43	Q4G163	708 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	EDEM1	Q92611	657 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	CD101	Q93033	1021 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	CHRD	Q9H2X0	955 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	SYNC	Q9H7C4	482 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HLA-B-254	ENST00000497377	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49

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