RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495581.1

SMIM29-208, Transcript of small integral membrane protein 29, humanhuman

TSL 2

Gene SMIM29, Length 911 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM29-208ENST00000495581 SLC20A1Q8WUM9 679 aa21.88■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 C18orf8Q96DM3 657 aa21.88■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 IER2Q9BTL4 223 aa21.88■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 SPHK2Q9NRA0 654 aa21.88■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 HSF2BPO75031 334 aa21.87■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 ERBB2P04626 1255 aa21.87■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 FYNP06241 537 aa21.87■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 CHRNB1P11230 501 aa21.87■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 DRD1P21728 446 aa21.87■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 CHKAP35790 457 aa21.87■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 GALK1P51570 392 aa21.87■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 FZD5Q13467 585 aa21.87■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 FIGNQ5HY92 759 aa21.87■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 TMEM196Q5HYL7 178 aa21.87■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 LY6G5CQ5SRR4 150 aa21.87■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 CD101Q93033 1021 aa21.87■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 IQCDQ96DY2 449 aa21.87■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 SERPINB11Q96P15 392 aa21.87■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 IFNKQ9P0W0 207 aa21.87■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 WDR35Q9P2L0 1181 aa21.87■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 TJP2Q9UDY2 1190 aa21.87■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa21.87■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 COL4A3Q01955 1670 aa21.87■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 KMT2EQ8IZD2 1858 aa21.86■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 KLKB1P03952 638 aa21.86■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 GABRB2P47870 512 aa21.86■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 NOMO3P69849 1222 aa21.86■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 FMO1Q01740 532 aa21.86■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 SLC6A3Q01959 620 aa21.86■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 ANO4Q32M45 955 aa21.86■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 NAA35Q5VZE5 725 aa21.86■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 NUGGCQ68CJ6 796 aa21.86■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa21.86■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 DENND1CQ8IV53 801 aa21.86■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 UNC45BQ8IWX7 931 aa21.86■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 CCDC26Q8TAB7 109 aa21.86■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 BAP1Q92560 729 aa21.86■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 CHFRQ96EP1 664 aa21.86■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa21.86■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 MIA3Q5JRA6 1907 aa21.85■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 CBFA2T2O43439 604 aa21.85■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 CHRNB2P17787 502 aa21.85■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 RING1Q06587 406 aa21.85■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 NNTQ13423 1086 aa21.85■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 CCINQ13939 588 aa21.85■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 OLFML1Q6UWY5 402 aa21.85■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 TMEM25Q86YD3 366 aa21.85■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 RNF214Q8ND24 703 aa21.85■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 CPA5Q8WXQ8 436 aa21.85■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 CHRDQ9H2X0 955 aa21.85■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 LATS1O95835 1130 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 SCNN1AP37088 669 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 TBX4P57082 545 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 CDK17Q00537 523 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 TAF5Q15542 800 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 FBXO43Q4G163 708 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 DCAF6Q58WW2 860 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 SFMBT2Q5VUG0 894 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 SYPL2Q5VXT5 272 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 FSTL4Q6MZW2 842 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 SLC26A9Q7LBE3 791 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 C1orf210Q8IVY1 113 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 SLC2A13Q96QE2 648 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 AGPAT1Q99943 283 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 BBS2Q9BXC9 721 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 MARK1Q9P0L2 795 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 TLR6Q9Y2C9 796 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 LRRC53A6NM62 1247 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 GBP1P32455 592 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 PBX1P40424 430 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 OPRD1P41143 372 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 NSFP46459 744 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 SLC11A2P49281 568 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 PTPN5P54829 565 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 ASIC2Q16515 512 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 GAB4Q2WGN9 574 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 TPGS1Q6ZTW0 290 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 DEFB106AQ8N104 65 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 CPXM2Q8N436 756 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 PNKPQ96T60 521 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 TTYH3Q9C0H2 523 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 RRN3Q9NYV6 651 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 AIPL1Q9NZN9 384 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM29-208ENST00000495581 WDFY4Q6ZS81 3184 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms