RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487411.5

STX4-210, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene STX4, Length 1,290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-210ENST00000487411 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 TYRP14679 529 aa23.62■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 CLCN1P35523 988 aa23.62■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 SYT13Q7L8C5 426 aa23.62■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 LONP2Q86WA8 852 aa23.62■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 SFTPA1Q8IWL2 248 aa23.62■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 FAM71AQ8IYT1 594 aa23.62■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 NAT16Q8N8M0 369 aa23.62■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 SUMF1Q8NBK3 374 aa23.62■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 VPS16Q9H269 839 aa23.62■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 EPC1Q9H2F5 836 aa23.62■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 PLCB1Q9NQ66 1216 aa23.62■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa23.62■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 MYOFQ9NZM1 2061 aa23.62■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 UCHL3P15374 230 aa23.61■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 CHKAP35790 457 aa23.61■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 FNTBP49356 437 aa23.61■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 SEC13P55735 322 aa23.61■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 PDCLQ13371 301 aa23.61■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 RAPGEF1Q13905 1077 aa23.61■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 TMEM110Q86TL2 294 aa23.61■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 DENND1CQ8IV53 801 aa23.61■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 FAM217AQ8IXS0 508 aa23.61■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 CPXM2Q8N436 756 aa23.61■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 TERB1Q8NA31 727 aa23.61■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 DMDP11532 3685 aa23.61■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 E5RJQ4 531 aa23.6■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 HOXC13P31276 330 aa23.6■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 TNFRSF4P43489 277 aa23.6■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 BPIFB4P59827 614 aa23.6■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 DMC1Q14565 340 aa23.6■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 NCAPHQ15003 741 aa23.6■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 GRAMD4Q6IC98 578 aa23.6■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 SLC47A2Q86VL8 602 aa23.6■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 WDR5BQ86VZ2 330 aa23.6■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 SCUBE3Q8IX30 993 aa23.6■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 CAMKK1Q8N5S9 505 aa23.6■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa23.6■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 LHX5Q9H2C1 402 aa23.6■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa23.59■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 ANTXRLA6NF34 631 aa23.59■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 MSI1O43347 362 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 LATS1O95835 1130 aa23.59■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 PENKP01210 267 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 FYNP06241 537 aa23.59■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 ZNF18P17022 549 aa23.59■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 HARS2P49590 506 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 COPB1P53618 953 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 C2orf27AQ580R0 203 aa23.59■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 FKBP15Q5T1M5 1219 aa23.59■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 BEND5Q7L4P6 421 aa23.59■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 WDTC1Q8N5D0 677 aa23.59■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 FAM149B1Q96BN6 582 aa23.59■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 P2RY11Q96G91 374 aa23.59■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 TRIM62Q9BVG3 475 aa23.59■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 GANQ9H2C0 597 aa23.59■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 MMP17Q9ULZ9 603 aa23.59■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 TBC1D3BA6NDS4 549 aa23.58■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 TRIM24O15164 1050 aa23.58■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 IGLV3-27P01718 113 aa23.58■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 NCAM1P13591 858 aa23.58■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 CNR2P34972 360 aa23.58■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 KRT9P35527 623 aa23.58■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 FYB2Q5VWT5 728 aa23.58■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 NUDT18Q6ZVK8 323 aa23.58■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 PASD1Q8IV76 773 aa23.58■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 HHIPQ96QV1 700 aa23.58■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 STK33Q9BYT3 514 aa23.58■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 HSD3B7Q9H2F3 369 aa23.58■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 FBXO10Q9UK96 956 aa23.58■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
STX4-210ENST00000487411 ATG2BQ96BY7 2078 aa23.58■■□□□ 1.36
STX4-210ENST00000487411 LGALS16A8MUM7 142 aa23.57■■□□□ 1.36
STX4-210ENST00000487411 F8VZ95 297 aa23.57■■□□□ 1.36
STX4-210ENST00000487411 RING1Q06587 406 aa23.57■■□□□ 1.36
STX4-210ENST00000487411 ANO6Q4KMQ2 910 aa23.57■■□□□ 1.36
STX4-210ENST00000487411 AOPEPQ8N6M6 819 aa23.57■■□□□ 1.36
STX4-210ENST00000487411 IL17RCQ8NAC3 791 aa23.57■■□□□ 1.36
STX4-210ENST00000487411 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
STX4-210ENST00000487411 KCNV2Q8TDN2 545 aa23.57■■□□□ 1.36
STX4-210ENST00000487411 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
STX4-210ENST00000487411 BHMTQ93088 406 aa23.57■■□□□ 1.36
STX4-210ENST00000487411 NOX5Q96PH1 765 aa23.57■■□□□ 1.36
STX4-210ENST00000487411 CPXM1Q96SM3 734 aa23.57■■□□□ 1.36
STX4-210ENST00000487411 BPIFA3Q9BQP9 254 aa23.57■■□□□ 1.36
STX4-210ENST00000487411 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
STX4-210ENST00000487411 PLK2Q9NYY3 685 aa23.57■■□□□ 1.36
STX4-210ENST00000487411 TJP2Q9UDY2 1190 aa23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms