RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447419.6

PTX4-203, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,516 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-203ENST00000447419 FMO1Q01740 532 aa21.42■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 CDR2Q01850 454 aa21.42■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 KDSRQ06136 332 aa21.42■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 TCF15Q12870 199 aa21.42■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 MTAPQ13126 283 aa21.42■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 GAS6Q14393 721 aa21.42■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 Q6ZNB5 142 aa21.42■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 SLC30A5Q8TAD4 765 aa21.42■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 CD101Q93033 1021 aa21.42■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 PCDHB18PQ96TA0 734 aa21.42■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 SPHK2Q9NRA0 654 aa21.42■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 FAM86C1Q9NVL1 165 aa21.42■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 COX16Q9P0S2 106 aa21.42■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 LRRC53A6NM62 1247 aa21.41■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa21.41■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 NCAM2O15394 837 aa21.41■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 ADH1CP00326 375 aa21.41■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 HOXC13P31276 330 aa21.41■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 TMEM196Q5HYL7 178 aa21.41■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 TAC4Q86UU9 113 aa21.41■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 BAP1Q92560 729 aa21.41■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 CLDN23Q96B33 292 aa21.41■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 MSANTD3Q96H12 275 aa21.41■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 OSBPL6Q9BZF3 934 aa21.41■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 C2orf42Q9NWW7 574 aa21.41■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 GOLGA8SH3BPF8 625 aa21.4■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 SEC13P55735 322 aa21.4■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 NOMO3P69849 1222 aa21.4■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 CCINQ13939 588 aa21.4■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 ANGPT1Q15389 498 aa21.4■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 DCAF6Q58WW2 860 aa21.4■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 PKN3Q6P5Z2 889 aa21.4■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 TSSK4Q6SA08 328 aa21.4■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 OLFML1Q6UWY5 402 aa21.4■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 ERICH1Q86X53 443 aa21.4■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 DEFB106AQ8N104 65 aa21.4■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 BBS2Q9BXC9 721 aa21.4■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 POPDC2Q9HBU9 364 aa21.4■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 SART1O43290 800 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 TSPAN3O60637 253 aa21.39■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 AMPD2Q01433 879 aa21.39■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 MSANTD2Q6P1R3 559 aa21.39■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa21.39■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 CPLX3Q8WVH0 158 aa21.39■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa21.39■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 ZNF318Q5VUA4 2279 aa21.39■■□□□ 1.02
PTX4-203ENST00000447419 F5P12259 2224 aa21.39■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 A0A1W2PQC6 194 aa21.39■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 HARS2P49590 506 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 TBX4P57082 545 aa21.39■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 GAD2Q05329 585 aa21.39■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 C1orf210Q8IVY1 113 aa21.39■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 PLD4Q96BZ4 506 aa21.39■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 OTUB2Q96DC9 234 aa21.39■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa21.39■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa21.38■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 RNF40O75150 1001 aa21.38■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 GJB6O95452 261 aa21.38■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 TYRP14679 529 aa21.38■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 SLC6A3Q01959 620 aa21.38■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 LRRC32Q14392 662 aa21.38■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 C1orf228Q6PIY5 440 aa21.38■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 XYLT1Q86Y38 959 aa21.38■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 C18orf8Q96DM3 657 aa21.38■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 C11orf70Q9BRQ4 267 aa21.38■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 CHRDQ9H2X0 955 aa21.38■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 LSM8O95777 96 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 RPS9P46781 194 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 EFHC1Q5JVL4 640 aa21.37■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa21.37■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa21.37■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 ZNF677Q86XU0 584 aa21.37■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 DNAAF5Q86Y56 855 aa21.37■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 KIAA1958Q8N8K9 716 aa21.37■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 AGPAT1Q99943 283 aa21.37■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 DCLK3Q9C098 648 aa21.37■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 TTYH3Q9C0H2 523 aa21.37■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 FAM204AQ9H8W3 233 aa21.37■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 ARHGEF4Q9NR80 690 aa21.37■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 LAMTOR5O43504 91 aa21.36■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 HSF2BPO75031 334 aa21.36■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 TULP3O75386 442 aa21.36■■□□□ 1.01
PTX4-203ENST00000447419 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms