RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 SLC22A12Q96S37 553 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 TBCBQ99426 244 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 NPY6RQ99463 290 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 SLC46A2Q9BY10 475 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 RNF38Q9H0F5 515 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 POMKQ9H5K3 350 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 DDIT4Q9NX09 232 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 XIRP2A4UGR9 3374 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 USP27XA6NNY8 438 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 PFKLP17858 780 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 AVPR1AP37288 418 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 HADHBP55084 474 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 NME3Q13232 169 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 REXO1L1PQ8IX06 675 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 NPAS3Q8IXF0 933 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 FAM172AQ8WUF8 416 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 NT5C3BQ969T7 300 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 SERPINB11Q96P15 392 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 LCMT1Q9UIC8 334 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 ZMYM5Q9UJ78 669 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 C5orf42Q9H799 3197 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 SOBPA7XYQ1 873 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 MOCS3O95396 460 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 OLFM2O95897 454 aa21.48■■□□□ 1.03
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HOXA4-202ENST00000428284 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 TPCN2Q8NHX9 752 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 KIAA1524Q8TCG1 905 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 SUSD6Q92537 303 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 FGF13Q92913 245 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 ADAM33Q9BZ11 813 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 SMPD4Q9NXE4 827 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 USTQ9Y2C2 406 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 SLC12A8A0AV02 714 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 GRXCR2A6NFK2 248 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 GBP1P32455 592 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 DEUP1Q05D60 604 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 CMTM8Q8IZV2 173 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 ZSWIM3Q96MP5 696 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 IRAK2O43187 625 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 MBTPS2O43462 519 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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HOXA4-202ENST00000428284 IGLV3-25P01717 112 aa21.46■■□□□ 1.03
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HOXA4-202ENST00000428284 DAAM2Q86T65 1068 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 NIPA2Q8N8Q9 360 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 PRDM6Q9NQX0 595 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 PIGVQ9NUD9 493 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 CDH7Q9ULB5 785 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 CPQQ9Y646 472 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA4-202ENST00000428284 F9P00740 461 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 HMBSP08397 361 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 SLC7A9P82251 487 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 ACAP1Q15027 740 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 RAB6CQ53S08 254 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 TTC16Q8NEE8 873 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 RNF34Q969K3 372 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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HOXA4-202ENST00000428284 GOLPH3Q9H4A6 298 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 GDE1Q9NZC3 331 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 TLR6Q9Y2C9 796 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 GRID2IPA4D2P6 1211 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 SSR1P43307 286 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 HDAC4P56524 1084 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 TBX4P57082 545 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 COG7P83436 770 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 NNTQ13423 1086 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 C11orf63Q6NUN7 778 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 POTEHQ6S545 545 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 BNIPLQ7Z465 357 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 THEGQ9P2T0 379 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA4-202ENST00000428284 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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