RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 WDR81Q562E7 1941 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 RRN3P2A6NIE6 340 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 DVL2O14641 736 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 FIBPO43427 364 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 NOBOXO60393 691 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 MGEA5O60502 916 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 RPS6KA5O75582 802 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 POLR2MP0CAP2 368 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 MYBP10242 640 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 HSD17B4P51659 736 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ACACAQ13085 2346 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 KRT72Q14CN4 511 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 UBXN2BQ14CS0 331 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 PTPN14Q15678 1187 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ANO4Q32M45 955 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ASPRV1Q53RT3 343 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 VPS53Q5VIR6 699 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 FSTL4Q6MZW2 842 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 B3GNT9Q6UX72 402 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 MFSD6Q6ZSS7 791 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 STOX1Q6ZVD7 989 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 SLC24A5Q71RS6 500 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 CATIPQ7Z7H3 387 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 VPS52Q8N1B4 723 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 PEX11GQ96HA9 241 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 C16orf92Q96LL3 132 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 TEKT5Q96M29 485 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 TTC14Q96N46 770 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 CD244Q9BZW8 370 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 CWH43Q9H720 699 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 JMJD4Q9H9V9 463 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ARHGEF3Q9NR81 526 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 CHST12Q9NRB3 414 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
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PTPRK-210ENST00000415055 ERAP1Q9NZ08 941 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 IGSF9Q9P2J2 1179 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 WNT16Q9UBV4 365 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 NUDT5Q9UKK9 219 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 GPR45Q9Y5Y3 372 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 GON4LQ3T8J9 2241 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 GREB1Q4ZG55 1949 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 LAMA4Q16363 1823 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 MYO18BQ8IUG5 2567 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 HGSO14964 777 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 SLC27A2O14975 620 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 MAFGO15525 162 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRK-210ENST00000415055 AGXTP21549 392 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 KLRC2P26717 231 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 CNR2P34972 360 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 NOVP48745 357 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 MTNR1BP49286 362 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 SLC9A5Q14940 896 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ODF1Q14990 250 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 LETM2Q2VYF4 491 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 COBLL1Q53SF7 1204 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 MARCH8Q5T0T0 291 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 STEAP3Q658P3 488 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRK-210ENST00000415055 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 IQCA1Q86XH1 822 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 LRRC43Q8N309 656 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 NETO2Q8NC67 525 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 SH3RF2Q8TEC5 729 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 CPA5Q8WXQ8 436 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 PIBF1Q8WXW3 757 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ESR2Q92731 530 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM117Q9H0C3 514 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 AZI2Q9H6S1 392 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 SFXN1Q9H9B4 322 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ANLNQ9NQW6 1124 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 RGS18Q9NS28 235 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 DNAJC28Q9NX36 388 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ANAPC4Q9UJX5 808 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 SQORQ9Y6N5 450 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-210ENST00000415055 DUSP10Q9Y6W6 482 aa5.09□□□□□ -1.59
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