RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414069.2

SPRN-201, Transcript of shadow of prion protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRN, Length 3,128 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRN-201ENST00000414069 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SPRN-201ENST00000414069 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa21.58■■□□□ 1.05
SPRN-201ENST00000414069 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 CTSHP09668 335 aa21.58■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 SP100P23497 879 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 TP53INP2Q8IXH6 220 aa21.58■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.04
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SPRN-201ENST00000414069 PPME1Q9Y570 386 aa21.58■■□□□ 1.04
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SPRN-201ENST00000414069 TCEA3O75764 348 aa21.57■■□□□ 1.04
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SPRN-201ENST00000414069 OLIG2Q13516 323 aa21.57■■□□□ 1.04
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SPRN-201ENST00000414069 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
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SPRN-201ENST00000414069 SLC27A1Q6PCB7 646 aa21.56■■□□□ 1.04
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SPRN-201ENST00000414069 METTL18O95568 372 aa21.56■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 GOT1P17174 413 aa21.56■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 GRM5P41594 1212 aa21.56■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 INCA1Q0VD86 236 aa21.56■■□□□ 1.04
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SPRN-201ENST00000414069 LGMNQ99538 433 aa21.56■■□□□ 1.04
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SPRN-201ENST00000414069 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
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SPRN-201ENST00000414069 SLC35F5Q8WV83 523 aa21.55■■□□□ 1.04
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SPRN-201ENST00000414069 FBXO47Q5MNV8 452 aa21.54■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 CES3Q6UWW8 571 aa21.54■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 PCGF5Q86SE9 256 aa21.54■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 RELL1Q8IUW5 271 aa21.54■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 SNX27Q96L92 541 aa21.54■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 NUDCD1Q96RS6 583 aa21.54■■□□□ 1.04
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