RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 FNIP1Q8TF40 1166 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 NACA2Q9H009 215 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 CDH7Q9ULB5 785 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 STAP1Q9ULZ2 295 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 CCP110O43303 1012 aa24.56■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 CKMP06732 381 aa24.56■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 SULT1E1P49888 294 aa24.56■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 SLC7A9P82251 487 aa24.56■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 ATP11AP98196 1134 aa24.56■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 TXLNBQ8N3L3 684 aa24.56■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 GDE1Q9NZC3 331 aa24.56■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 ZMYM5Q9UJ78 669 aa24.56■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 M0QYT0 321 aa24.55■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 PRAMEF12O95522 483 aa24.55■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 HADHBP55084 474 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 CDO1Q16878 200 aa24.55■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF662Q6ZS27 426 aa24.55■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 CNPY3Q9BT09 278 aa24.55■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 FAM204AQ9H8W3 233 aa24.55■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 SMPD4Q9NXE4 827 aa24.55■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 RRN3Q9NYV6 651 aa24.55■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 CCL26Q9Y258 94 aa24.55■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 BUB1O43683 1085 aa24.54■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 PSMA2P25787 234 aa24.54■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 AVPR1AP37288 418 aa24.54■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 NOP2P46087 812 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 FAM78AQ5JUQ0 283 aa24.54■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 LZTFL1Q9NQ48 299 aa24.54■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 GKN1Q9NS71 199 aa24.54■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 PIGVQ9NUD9 493 aa24.54■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 DDIT4Q9NX09 232 aa24.54■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 CPQQ9Y646 472 aa24.54■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 MYO1FO00160 1098 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 IRAK2O43187 625 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 SP100P23497 879 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 NME3Q13232 169 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 REXO1L1PQ8IX06 675 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 FAM172AQ8WUF8 416 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 ASB16Q96NS5 453 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 SERPINB11Q96P15 392 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 COX16Q9P0S2 106 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 IP6K2Q9UHH9 426 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 SLC12A8A0AV02 714 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 MACROD2A1Z1Q3 448 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 USP27XA6NNY8 438 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 ENDOD1O94919 500 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 WEE1P30291 646 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 HDAC4P56524 1084 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 HS1BP3Q53T59 392 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 CPNE8Q86YQ8 564 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 TSGA10Q9BZW7 698 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 TLR6Q9Y2C9 796 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 HMBSP08397 361 aa24.52■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 LAMP2P13473 410 aa24.52■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 STRADAQ7RTN6 431 aa24.52■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 NIPA2Q8N8Q9 360 aa24.52■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 TPCN2Q8NHX9 752 aa24.52■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 RIN3Q8TB24 985 aa24.52■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 SMARCD2Q92925 531 aa24.52■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 WBP2Q969T9 261 aa24.52■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 TDP1Q9NUW8 608 aa24.52■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 GUCA1BQ9UMX6 200 aa24.52■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 KRT86O43790 486 aa24.51■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 PROSCO94903 275 aa24.51■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 IGLV3-27P01718 113 aa24.51■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 IL9P15248 144 aa24.51■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 FCARP24071 287 aa24.51■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 RDXP35241 583 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 KCNQ1P51787 676 aa24.51■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 DEUP1Q05D60 604 aa24.51■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 NNTQ13423 1086 aa24.51■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 MESDQ14696 234 aa24.51■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 RSPRY1Q96DX4 576 aa24.51■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 SLC39A13Q96H72 371 aa24.51■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 USTQ9Y2C2 406 aa24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms