RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326039.3

GRTP1-201, Transcript of growth hormone regulated TBC protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GRTP1, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1-201ENST00000326039 IER2Q9BTL4 223 aa21.48■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 A0A1B0GTH6 734 aa21.47■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 LAMTOR5O43504 91 aa21.47■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 NCAM1P13591 858 aa21.47■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 NBL1P41271 181 aa21.47■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 NR1I3Q14994 352 aa21.47■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 TAF5Q15542 800 aa21.47■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 NFKBIBQ15653 356 aa21.47■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 FILIP1LQ4L180 1135 aa21.47■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 TAF3Q5VWG9 929 aa21.47■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 Q6ZS52 159 aa21.47■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 C12orf40Q86WS4 652 aa21.47■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 SPEM1Q8N4L4 309 aa21.47■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 TMEM35BQ8NCS4 154 aa21.47■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 PLD4Q96BZ4 506 aa21.47■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 NOX5Q96PH1 765 aa21.47■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 PDCL3Q9H2J4 239 aa21.47■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa21.47■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 MYO15AQ9UKN7 3530 aa21.46■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 A0A0A0MRY4 1105 aa21.46■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 ERBB2P04626 1255 aa21.46■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 MMEP08473 750 aa21.46■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 MESP2Q0VG99 397 aa21.46■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 PTPN20Q4JDL3 420 aa21.46■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 SYPL2Q5VXT5 272 aa21.46■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 ZNF677Q86XU0 584 aa21.46■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 DENND1CQ8IV53 801 aa21.46■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa21.46■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 FAM149B1Q96BN6 582 aa21.46■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 P2RY11Q96G91 374 aa21.46■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 MARK1Q9P0L2 795 aa21.46■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 CEP83Q9Y592 693 aa21.46■■□□□ 1.03
GRTP1-201ENST00000326039 PRR23AA6NEV1 266 aa21.45■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 PROB1E7EW31 1015 aa21.45■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 K7EQS6 105 aa21.45■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 SP9P0CG40 484 aa21.45■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 CHRNB2P17787 502 aa21.45■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 SNX16P57768 344 aa21.45■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 ANO4Q32M45 955 aa21.45■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 FBXO43Q4G163 708 aa21.45■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 TPGS1Q6ZTW0 290 aa21.45■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 NAT16Q8N8M0 369 aa21.45■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 SLC20A1Q8WUM9 679 aa21.45■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 PNKPQ96T60 521 aa21.45■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 POPDC2Q9HBU9 364 aa21.45■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 WDR35Q9P2L0 1181 aa21.45■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 FBXO4Q9UKT5 387 aa21.45■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 A0A1W2PQC6 194 aa21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 LSM8O95777 96 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 SERPINC1P01008 464 aa21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 IGLV3-27P01718 113 aa21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 GLI1P08151 1106 aa21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 CHKAP35790 457 aa21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 GABRB2P47870 512 aa21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 HARS2P49590 506 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 TPM4P67936 248 aa21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 FANCCQ00597 558 aa21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 CDR2Q01850 454 aa21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 EFHC1Q5JVL4 640 aa21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 OR6B2Q6IFH4 312 aa21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 PKN3Q6P5Z2 889 aa21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 FAM217AQ8IXS0 508 aa21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 PHTF2Q8N3S3 785 aa21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 TRIM62Q9BVG3 475 aa21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 ASNSD1Q9NWL6 643 aa21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 C2orf42Q9NWW7 574 aa21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 STOML2Q9UJZ1 356 aa21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 R4GN57 208 aa21.44■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 CAPN9O14815 690 aa21.43■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 TULP3O75386 442 aa21.43■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 TYRP14679 529 aa21.43■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 CXCL12P48061 93 aa21.43■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 CCR3P51677 355 aa21.43■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 TBX4P57082 545 aa21.43■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 FMO1Q01740 532 aa21.43■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 SLC6A3Q01959 620 aa21.43■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 ZNF528Q3MIS6 628 aa21.43■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 OLFML1Q6UWY5 402 aa21.43■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa21.43■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 CPA5Q8WXQ8 436 aa21.43■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 SLC2A13Q96QE2 648 aa21.43■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 BBS2Q9BXC9 721 aa21.43■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 ANTXRLA6NF34 631 aa21.42■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa21.42■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa21.42■■□□□ 1.02
GRTP1-201ENST00000326039 RNF40O75150 1001 aa21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms