RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	CATSPER2	Q96P56	530 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	GBP5	Q96PP8	586 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	RAB20	Q9NX57	234 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	TGM5	O43548	720 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	SOD2	P04179	222 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	C8A	P07357	584 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	ODC1	P11926	461 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	MTMR3	Q13615	1198 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	MAP7	Q14244	749 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	PSMD6	Q15008	389 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	PACS1	Q6VY07	963 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	WDR49	Q8IV35	697 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	HIC2	Q96JB3	615 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF560	Q96MR9	790 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	SH3GL1	Q99961	368 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	COX16	Q9P0S2	106 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	TEX33	O43247	280 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	PIGR	P01833	764 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	KRT14	P02533	472 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	ADH1A	P07327	375 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	FMO5	P49326	533 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	RGS7	P49802	495 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	NDST1	P52848	882 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	ROR1	Q01973	937 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	HYAL1	Q12794	435 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	KRT31	Q15323	416 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	SV2C	Q496J9	727 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	KLC3	Q6P597	504 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	UBA3	Q8TBC4	463 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	NACC2	Q96BF6	587 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	SUPT3H	O75486	399 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	VNN1	O95497	513 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	PDHA1	P08559	390 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNE1	P15382	129 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	DRD4	P21917	467 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	VAV2	P52735	878 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	TSPY1	Q01534	308 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	NAB2	Q15742	525 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNK16	Q96T55	309 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	F5	P12259	2224 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	WDR27	A2RRH5	827 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	MFAP3L	O75121	409 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	LRG1	P02750	347 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00271	P0C7V0	271 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	CCT8	P50990	548 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	PDE1B	Q01064	536 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-238	ENST00000623495	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2

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