RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa23.3■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 M0QYT0 321 aa23.29■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 OAZ2O95190 189 aa23.29■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 TTC4O95801 387 aa23.29■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 F9P00740 461 aa23.29■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 LTFP02788 710 aa23.29■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 ITGB1P05556 798 aa23.29■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 BDNFP23560 247 aa23.29■■□□□ 1.32
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USP36-218ENST00000590546 DEUP1Q05D60 604 aa23.29■■□□□ 1.32
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USP36-218ENST00000590546 BEND5Q7L4P6 421 aa23.29■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
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USP36-218ENST00000590546 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 NRP1O14786 923 aa23.29■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa23.29■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 ACTN2P35609 894 aa23.29■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 XRCC4Q13426 336 aa23.29■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 C6orf118Q5T5N4 469 aa23.29■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 PPIL6Q8IXY8 311 aa23.29■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 NTAN1Q96AB6 310 aa23.29■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 ADAM33Q9BZ11 813 aa23.29■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 MTMR10Q9NXD2 777 aa23.29■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 LRFN2Q9ULH4 789 aa23.29■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
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USP36-218ENST00000590546 E7ENQ6 273 aa23.28■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 H7C0C1 242 aa23.28■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 TADA2AO75478 443 aa23.28■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 USP17L7P0C7H9 530 aa23.28■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 ETS1P14921 441 aa23.28■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 ATP5OP48047 213 aa23.28■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 CACNA2D1P54289 1103 aa23.28■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 SKOR1P84550 965 aa23.28■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 KCTD16Q68DU8 428 aa23.28■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 C4orf22Q6V702 233 aa23.28■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 FAM131BQ86XD5 332 aa23.28■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 CCDC185Q8N715 623 aa23.28■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 RNF208Q9H0X6 261 aa23.28■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 CENPHQ9H3R5 247 aa23.28■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 GPNMBQ14956 572 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 SYPL2Q5VXT5 272 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 C1orf228Q6PIY5 440 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 KDM7AQ6ZMT4 941 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 PRUNE1Q86TP1 453 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 UNC45BQ8IWX7 931 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 PGM2Q96G03 612 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 TTC25Q96NG3 672 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 CSPG4P5Q96PW8 444 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
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USP36-218ENST00000590546 TMEM30AQ9NV96 361 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 USP3Q9Y6I4 520 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 H3BRJ5 948 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 FYNP06241 537 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 CCL5P13501 91 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 RPL22P35268 128 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 LMAN1P49257 510 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 EFHC2Q5JST6 749 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 NPNTQ6UXI9 565 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 HFE2Q6ZVN8 426 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 LRRTM3Q86VH5 581 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 FAM71DQ8N9W8 422 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 RTP4Q96DX8 246 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 COLEC11Q9BWP8 271 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 TMLHEQ9NVH6 421 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 TMEM51Q9NW97 253 aa23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
USP36-218ENST00000590546 B4GALT3O60512 393 aa23.26■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 NCAM1P13591 858 aa23.26■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 NR1D1P20393 614 aa23.26■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 GDF10P55107 478 aa23.26■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 SCAPQ12770 1279 aa23.26■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 ARL13BQ3SXY8 428 aa23.26■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa23.26■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 SLC7A14Q8TBB6 771 aa23.26■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa23.26■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
USP36-218ENST00000590546 PAK5Q9P286 719 aa23.26■■□□□ 1.31
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