RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC9A4Q6AI14 798 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1-202ENST00000586851 SWSAP1Q6NVH7 229 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1-202ENST00000586851 KLC3Q6P597 504 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1-202ENST00000586851 RFWD3Q6PCD5 774 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1-202ENST00000586851 PGM2L1Q6PCE3 622 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1-202ENST00000586851 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8□□□□□ -1.13
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CAPNS1-202ENST00000586851 CTAGE3PQ8IX95 158 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1-202ENST00000586851 GLIS1Q8NBF1 620 aa8□□□□□ -1.13
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CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF341Q9BYN7 854 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1-202ENST00000586851 POPDC2Q9HBU9 364 aa8□□□□□ -1.13
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CAPNS1-202ENST00000586851 RNF146Q9NTX7 359 aa8□□□□□ -1.13
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CAPNS1-202ENST00000586851 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8□□□□□ -1.13
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CAPNS1-202ENST00000586851 RAD54BQ9Y620 910 aa8□□□□□ -1.13
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CAPNS1-202ENST00000586851 SERPINB5P36952 375 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1-202ENST00000586851 RPL5P46777 297 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
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CAPNS1-202ENST00000586851 FAM81AQ8TBF8 368 aa7.99□□□□□ -1.13
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CAPNS1-202ENST00000586851 ZWILCHQ9H900 591 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1-202ENST00000586851 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1-202ENST00000586851 ETNK2Q9NVF9 386 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1-202ENST00000586851 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.99□□□□□ -1.13
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