RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585666.5

PTPN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 2, human

TSL 3

Gene PTPN2, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN2-204	ENST00000585666	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666		Q8TCH9	128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	CPT1B	Q92523	772 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	PATE3	B3GLJ2	98 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	EXOC5	O00471	708 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	TRIAP1	O43715	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	WDR47	O94967	919 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	PPP3CB	P16298	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	ZNF20	P17024	532 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	DRD1	P21728	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	VAV2	P52735	878 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	CASP6	P55212	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	KCTD2	Q14681	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	P3H1	Q32P28	736 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	TSPYL6	Q8N831	410 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	GLG1	Q92896	1179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	LOXL4	Q96JB6	756 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	ADAM2	Q99965	735 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666		A0A1W2PPH5	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	MUSK	O15146	869 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	TRIM24	O15164	1050 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	CYP27B1	O15528	508 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	KLK10	O43240	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	ALAD	P13716	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	COMT	P21964	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	DCAF7	P61962	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	REST	Q13127	1097 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	LPIN2	Q92539	896 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN2-204	ENST00000585666	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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