RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 TATDN2Q93075 761 aa21.95■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 MPP3Q13368 585 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 YY1P25490 414 aa21.94■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 TRIM63Q969Q1 353 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 KAZALD1Q96I82 304 aa21.94■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 TMC3Q7Z5M5 1100 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGEF19Q8IW93 802 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 DEFB107AQ8IZN7 70 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 NMRK1Q9NWW6 199 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 FAM153CQ494X1 144 aa21.94■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 APBB2Q92870 758 aa21.94■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 DOLKQ9UPQ8 538 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 RRM2P31350 389 aa21.93■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa21.93■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 C4orf19Q8IY42 314 aa21.93■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF844Q08AG5 666 aa21.92■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa21.92■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 BST2Q10589 180 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 WASHC2DQ5SRD0 308 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa21.91■■□□□ 1.1
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