RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SEPT4O43236 478 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATP2C2O75185 946 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BANF1O75531 89 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FBXO21O94952 628 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM200BP0CF97 657 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RBL1P28749 1068 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NOS2P35228 1153 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARL4AP40617 200 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MLH1P40692 756 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TM4SF4P48230 202 aa22.17■■□□□ 1.14
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LRRC14Q15048 493 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DEFB106AQ8N104 65 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM149B1Q96BN6 582 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SMC6Q96SB8 1091 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GAD1Q99259 594 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PGK1P00558 417 aa22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CHRNA1P02708 482 aa22.16■■□□□ 1.14
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAGEA6P43360 314 aa22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RAB27AP51159 221 aa22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADCY1Q08828 1119 aa22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC45A4Q5BKX6 768 aa22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRIB2Q92519 343 aa22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAGEB18Q96M61 343 aa22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CSPG4P5Q96PW8 444 aa22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CTSHP09668 335 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SSTR1P30872 391 aa22.15■■□□□ 1.14
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MGAT3Q09327 533 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MPP2Q14168 576 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC185Q8N715 623 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SYT15Q9BQS2 421 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MTMR10Q9NXD2 777 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FZD10Q9ULW2 581 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FOXO6A8MYZ6 492 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HACD1B0YJ81 288 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TCP11X1B4DZS4 312 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CLDN5O00501 218 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GCATO75600 419 aa22.15■■□□□ 1.14
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PAQR9Q6ZVX9 377 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FBF1Q8TES7 1133 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC2A13Q96QE2 648 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CYTH2Q99418 400 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DHRS4Q9BTZ2 278 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARL5CA6NH57 179 aa22.14■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 H3BRJ5 948 aa22.14■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MSH2P43246 934 aa22.14■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DCAF6Q58WW2 860 aa22.14■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADGRD1Q6QNK2 874 aa22.14■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MCUQ8NE86 351 aa22.14■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NT5C3BQ969T7 300 aa22.14■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADAM33Q9BZ11 813 aa22.14■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KRT82Q9NSB4 513 aa22.14■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDH9Q9ULB4 789 aa22.14■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.14■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF623O75123 536 aa22.13■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PAX3P23760 479 aa22.13■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ELK3P41970 407 aa22.13■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NPY6RQ99463 290 aa22.13■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 POPDC2Q9HBU9 364 aa22.13■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.13■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CHMP2BQ9UQN3 213 aa22.13■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TEX264Q9Y6I9 313 aa22.13■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FSBPO95073 299 aa22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCSK1P29120 753 aa22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FLT3LGP49771 235 aa22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LIG3P49916 1009 aa22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CLCNKBP51801 687 aa22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NRLP54845 237 aa22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AIF1P55008 147 aa22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GBE1Q04446 702 aa22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BNIPLQ7Z465 357 aa22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 VPS52Q8N1B4 723 aa22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GDAP1Q8TB36 358 aa22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WNT8BQ93098 351 aa22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LRRC39Q96DD0 335 aa22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PAFAH2Q99487 392 aa22.12■■□□□ 1.13
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