RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556778.5

PRKCH-222, Transcript of protein kinase C eta, human

TSL 4

Gene PRKCH, Length 545 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCH-222	ENST00000556778	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	NXPE3	Q969Y0	559 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	CHFR	Q96EP1	664 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	P2RY11	Q96G91	374 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	SPAG5	Q96R06	1193 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	EBF3	Q9H4W6	596 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	BRD9	Q9H8M2	597 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	EHD2	Q9NZN4	543 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	COL4A3	Q01955	1670 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	TTC28	Q96AY4	2481 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	ANTXRL	A6NF34	631 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	TMEM221	A6NGB7	291 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778		M0R296	226 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNF263	O14978	683 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	PI15	O43692	258 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	GRAP2	O75791	330 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	KLKB1	P03952	638 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	RFX1	P22670	979 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	FMO1	Q01740	532 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	MTF1	Q14872	753 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	STIL	Q15468	1287 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNF77	Q15935	545 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	ADAM32	Q8TC27	787 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	HSFY1	Q96LI6	401 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	NACA2	Q9H009	215 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	LHX5	Q9H2C1	402 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	CYLD	Q9NQC7	956 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	HPS4	Q9NQG7	708 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	NOTCH4	Q99466	2003 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	SOBP	A7XYQ1	873 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	GJB6	O95452	261 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	GYPC	P04921	128 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	PDE6C	P51160	858 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	MMP16	P51512	607 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	BPIFB4	P59827	614 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	CDR2	Q01850	454 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	NAA35	Q5VZE5	725 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	YAF2	Q8IY57	180 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	FLCN	Q8NFG4	579 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	STK32A	Q8WU08	396 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	AGPAT1	Q99943	283 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	SYT11	Q9BT88	431 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	FOXQ1	Q9C009	403 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	WNT16	Q9UBV4	365 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	SLC12A8	A0AV02	714 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	CHAD	O15335	359 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	RALA	P11233	206 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	CASP14	P31944	242 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	TUB	P50607	506 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
PRKCH-222	ENST00000556778	NOMO3	P69849	1222 aa		9.22	□□□□□ -0.93

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