RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513139.1

SPCS3-204, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

TSL 2

Gene SPCS3, Length 589 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-204ENST00000513139 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 METRNQ9UJH8 293 aa14.74□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 NME7Q9Y5B8 376 aa14.74□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 NUMA1Q14980 2115 aa14.74□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 ZNF462Q96JM2 2506 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 ZNF233A6NK53 670 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 NPC1O15118 1278 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 NCAM1P13591 858 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 TYRP14679 529 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 OXTRP30559 389 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 CASP5P51878 434 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 GRIN1Q05586 938 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 HLA-BQ31612 363 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 WDR49Q8IV35 697 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 OR6B3Q8NGW1 331 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 RHBDD1Q8TEB9 315 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 BBS2Q9BXC9 721 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 B3GNT5Q9BYG0 378 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 SLC6A17Q9H1V8 727 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 IL21RQ9HBE5 538 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 MYLKQ15746 1914 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 ATMQ13315 3056 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 ATP8B3O60423 1300 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 METTL12A8MUP2 240 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 H3BQV1 296 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 GREM1O60565 184 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 IGLV3-19P01714 112 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 SYT1P21579 422 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 DGKGP49619 791 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 BNC1Q01954 994 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 STARD3Q14849 445 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 SCAMP5Q8TAC9 235 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 WBP2Q969T9 261 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 GPR174Q9BXC1 333 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 NACA2Q9H009 215 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 PCED1AQ9H1Q7 454 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 KIAA1586Q9HCI6 787 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.053e-13■■■■■ 574.5
SPCS3-204ENST00000513139 RAD54BQ9Y620 910 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 MGAQ8IWI9 3026 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 CLDN5O00501 218 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 TNFSF14O43557 240 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 CISD3P0C7P0 127 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 IRF1P10914 325 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 ABCG1P45844 678 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 TPMTP51580 245 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 SLC5A3P53794 718 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 WDR72Q3MJ13 1102 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 FUT11Q495W5 492 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 SV2BQ7L1I2 683 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 C1orf216Q8TAB5 229 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 EPSTI1Q96J88 318 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 KCNK16Q96T55 309 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 DPEP3Q9H4B8 488 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 CCDC39Q9UFE4 941 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 FBXO10Q9UK96 956 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 STON1Q9Y6Q2 735 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS3-204ENST00000513139 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SPCS3-204ENST00000513139 COL6A6A6NMZ7 2263 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS3-204ENST00000513139 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SPCS3-204ENST00000513139 A8MXQ7 604 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS3-204ENST00000513139 KCNJ18B7U540 433 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS3-204ENST00000513139 WASH3PC4AMC7 463 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS3-204ENST00000513139 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SPCS3-204ENST00000513139 TLR5O60602 858 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS3-204ENST00000513139 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SPCS3-204ENST00000513139 CST3P01034 146 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SPCS3-204ENST00000513139 PDCP20941 246 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS3-204ENST00000513139 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SPCS3-204ENST00000513139 TNNC1P63316 161 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS3-204ENST00000513139 GOLGA8FQ08AF8 430 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS3-204ENST00000513139 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS3-204ENST00000513139 ENPP2Q13822 863 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS3-204ENST00000513139 E2F5Q15329 346 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS3-204ENST00000513139 PTPRNQ16849 979 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS3-204ENST00000513139 CBWD2Q8IUF1 395 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms