RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 LATS1O95835 1130 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 ADH1CP00326 375 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 CALCAP01258 141 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC2A3P11169 496 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 CHKAP35790 457 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 MAGEA9P43362 315 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 NUBP1P53384 320 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 NOMO3P69849 1222 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 CDK17Q00537 523 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 FMO1Q01740 532 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC6A3Q01959 620 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 RING1Q06587 406 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 EFEMP1Q12805 493 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 RUNX3Q13761 415 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 NUGGCQ68CJ6 796 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 POTEHQ6S545 545 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 NUDT18Q6ZVK8 323 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 ARCQ7LC44 396 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM11Q96F44 468 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 VCPIP1Q96JH7 1222 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC22A12Q96S37 553 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM83CQ9BQN1 747 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 OSBPL6Q9BZF3 934 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 SMPD4Q9NXE4 827 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 STAP1Q9ULZ2 295 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 CCL26Q9Y258 94 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 PATJQ8NI35 1801 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-208ENST00000504294 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKRD62A6NC57 917 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 NARSO43776 548 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 F9P00740 461 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SERPING1P05155 500 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 GZMAP12544 262 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CLCN5P51795 746 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 STARD6P59095 220 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CENPCQ03188 943 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 NAA35Q5VZE5 725 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC26A9Q7LBE3 791 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 MIB1Q86YT6 1006 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CNGA4Q8IV77 575 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 VSTM4Q8IW00 320 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SIX5Q8N196 739 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 TTC16Q8NEE8 873 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 OR8K1Q8NGG5 319 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 PBXIP1Q96AQ6 731 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 OSER1Q9NX31 292 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 BDP1A6H8Y1 2624 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC12A8A0AV02 714 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 TBX18O95935 607 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CYBBP04839 570 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 MMP8P22894 467 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 NOS2P35228 1153 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC11A2P49281 568 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 E2F5Q15329 346 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ACAD10Q6JQN1 1059 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 BHLHA9Q7RTU4 235 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CPLX3Q8WVH0 158 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CPA5Q8WXQ8 436 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 EDEM1Q92611 657 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 AZIN2Q96A70 460 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 RSPRY1Q96DX4 576 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ASIC4Q96FT7 647 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 IER2Q9BTL4 223 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SMOC2Q9H3U7 446 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 EPHX3Q9H6B9 360 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ADAM22Q9P0K1 906 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CYTH4Q9UIA0 394 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CA14Q9ULX7 337 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 TLR6Q9Y2C9 796 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 DENND4CQ5VZ89 1909 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 KANSL1LA0AUZ9 987 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ARNTLO00327 626 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 PIK3R2O00459 728 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 UNGP13051 313 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 MATKP42679 507 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 GSCP56915 257 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 GAD2Q05329 585 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 PTPN20Q4JDL3 420 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 OLFML1Q6UWY5 402 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 GPIHBP1Q8IV16 184 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC20A1Q8WUM9 679 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM3CQ92520 227 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms