RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, human

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKP4-208	ENST00000462335	CHKA	P35790	457 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	SLC11A2	P49281	568 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	STARD6	P59095	220 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	CDK17	Q00537	523 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	CDR2	Q01850	454 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	PDCL	Q13371	301 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	PPP2R5D	Q14738	602 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	NR1I3	Q14994	352 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	PKDCC	Q504Y2	493 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	POTEH	Q6S545	545 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	SCD5	Q86SK9	330 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	ZNF276	Q8N554	614 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	ASIC4	Q96FT7	647 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	ECT2	Q9H8V3	914 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	NMUR1	Q9HB89	426 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	MYO6	Q9UM54	1294 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	HSF2BP	O75031	334 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	APOE	P02649	317 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	MME	P08473	750 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	TCF3	P15923	654 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	AOC1	P19801	751 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	MAGEA9	P43362	315 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	SOX9	P48436	509 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	TBX4	P57082	545 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	GAD2	Q05329	585 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	USP4	Q13107	963 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	PON2	Q15165	354 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	DCAF6	Q58WW2	860 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	NAA35	Q5VZE5	725 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	TMEM110	Q86TL2	294 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	DENND1C	Q8IV53	801 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	SCML4	Q8N228	414 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	PJA1	Q8NG27	643 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	PLD4	Q96BZ4	506 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	AGPAT1	Q99943	283 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	FOXQ1	Q9C009	403 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	TRIM5	Q9C035	493 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	OSER1	Q9NX31	292 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	COX16	Q9P0S2	106 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	OBSL1	O75147	1896 aa		10	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	FAM170A	A1A519	330 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	GRAP2	O75791	330 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	OLFM2	O95897	454 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	APOD	P05090	189 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	GLI1	P08151	1106 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	SLC2A3	P11169	496 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	ADH5	P11766	374 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	DRD1	P21728	446 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	CTH	P32929	405 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	PGF	P49763	221 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	JAM2	P57087	298 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	ZNF445	P59923	1031 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	SLC6A3	Q01959	620 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PKP4-208	ENST00000462335	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		9.99	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms