RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 FAM184BQ9ULE4 1060 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SNX13Q9Y5W8 968 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC78A2IDD5 438 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC160A6NGH7 325 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 LAG3P18627 525 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 AGAP20933 346 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 NNMTP40261 264 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 KIR3DL1P43629 444 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 CCR9P51686 369 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 WNT3P56703 355 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 TPM4P67936 248 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 WTAPQ15007 396 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ELOA3BQ3SY89 546 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 FDX2Q6P4F2 183 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ARL10Q8N8L6 244 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 FAM181AQ8N9Y4 354 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 LINS1Q8NG48 757 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ELOA3Q8NG57 546 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 NFKBIDQ8NI38 313 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 CEP76Q8TAP6 659 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SLC5A11Q8WWX8 675 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 TCTN2Q96GX1 697 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SNX27Q96L92 541 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 COG8Q96MW5 612 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 MED15Q96RN5 788 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 WDR24Q96S15 920 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SIN3AQ96ST3 1273 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 CARD11Q9BXL7 1154 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ZWILCHQ9H900 591 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 RXFP1Q9HBX9 757 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 LTB4R2Q9NPC1 389 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 FSCN3Q9NQT6 498 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ASH2LQ9UBL3 628 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 RASAL2Q9UJF2 1139 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 APPL1Q9UKG1 709 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 FRMD3A2A2Y4 597 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 NOTOA8MTQ0 251 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 NFIBO00712 420 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 MCF2LO15068 1137 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 STARD3NLO95772 234 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 RHOXF2BP0C7M4 288 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 XBP1P17861 261 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 GJA4P35212 333 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ETV3P41162 512 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 BCL6P41182 706 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 DPP6P42658 865 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 MNAT1P51948 309 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC173Q0VFZ6 552 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 CTBP1Q13363 440 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 MPP7Q5T2T1 576 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SUSD1Q6UWL2 747 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF804AQ7Z570 1209 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 GALNT7Q86SF2 657 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 DSG4Q86SJ6 1040 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SLCO6A1Q86UG4 719 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP2.69□□□□□ -1.989e-8■■□□□ 13.9
CCSAP-202ENST00000366686 ARRDC4Q8NCT1 418 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SLC22A18Q96BI1 424 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 RNF125Q96EQ8 232 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 TIGD1Q96MW7 591 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 RHOXF2Q9BQY4 288 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ENKD1Q9H0I2 346 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 EPB41L1Q9H4G0 881 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 MID1IP1Q9NPA3 183 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SELENONQ9NZV5 590 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 KALRNO60229 2985 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 MGAMO43451 1857 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SAC3D1A6NKF1 404 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SCDO00767 359 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 HGSO14964 777 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 WBP4O75554 376 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 DGKIO75912 1065 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 PDE8BO95263 885 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 TPM1P09493 284 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 DLG4P78352 724 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 MC1RQ01726 317 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ZBTB16Q05516 673 aa2.69□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SGCGQ13326 291 aa2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms