RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 NPR3P17342 541 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PMLP29590 882 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 GGCXP38435 758 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SIGLEC14Q08ET2 396 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 FOXC1Q12948 553 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 RAB33AQ14088 237 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PLCL1Q15111 1095 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 KYNUQ16719 465 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 FBXO43Q4G163 708 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD40Q6AI12 368 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 DOK6Q6PKX4 331 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 VITQ6UXI7 678 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 GPR149Q86SP6 731 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ADSSL1Q8N142 457 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PDCL2Q8N4E4 241 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 C12orf29Q8N999 325 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CCHCR1Q8TD31 782 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CPA5Q8WXQ8 436 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 GLMNQ92990 594 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 FGD4Q96M96 766 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 BTBD1Q9H0C5 482 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 EPHX3Q9H6B9 360 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 GUCA1BQ9UMX6 200 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 C2CD4DB7Z1M9 353 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 KLRC4O43908 158 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 KIF5CO60282 957 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 RNF40O75150 1001 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TACC1O75410 805 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 RPP40O75818 363 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 AMD1P17707 334 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 VPS41P49754 854 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 DSG1Q02413 1049 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MBTPS1Q14703 1052 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MPPE1Q53F39 396 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ARSHQ5FYA8 562 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ERAP2Q6P179 960 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TAS1R1Q7RTX1 841 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SPRED2Q7Z698 418 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 OOSP2Q86WS3 158 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CFAP52Q8N1V2 620 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 UBL4BQ8N7F7 174 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 VN1R2Q8NFZ6 395 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SLC30A5Q8TAD4 765 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA20Q8TB22 786 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 RUBCNQ92622 972 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC19Q96DA6 116 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 BPIFA3Q9BQP9 254 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 GPR174Q9BXC1 333 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 GPR63Q9BZJ6 419 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 OLFML3Q9NRN5 406 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ABCC13Q9NSE7 274 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PRKAG3Q9UGI9 489 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 L1RE1Q9UN81 338 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MYH15Q9Y2K3 1946 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MTMR11A4FU01 709 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CXCL10P02778 98 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SAT1P21673 171 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 FNTBP49356 437 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SCNN1BP51168 640 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF75DP51815 510 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 COPB1P53618 953 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SLC12A2P55011 1212 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MYBPC2Q14324 1141 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 NUMA1Q14980 2115 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R7Q15435 360 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 FAXCQ5TGI0 409 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TAS2R42Q7RTR8 314 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PHACTR4Q8IZ21 702 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 EHBP1Q8NDI1 1231 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TMC2Q8TDI7 906 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TATDN2Q93075 761 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 FEM1CQ96JP0 617 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 FSD1LQ9BXM9 530 aa4.61□□□□□ -1.67
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