RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341403.9

UBXN8-202, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-202ENST00000341403 ETNK2Q9NVF9 386 aa9.87□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 SLAIN2Q9P270 581 aa9.87□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 HSFX1Q9UBD0 423 aa9.87□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 FADS3Q9Y5Q0 445 aa9.87□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 SIP14410 1827 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 ARID2Q68CP9 1835 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 FAM159BA6NKW6 160 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 KPNA7A9QM74 516 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 TRIM49D1C9J1S8 452 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 MAFGO15525 162 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 DNAJA2O60884 412 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 STAM2O75886 525 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 PDE5AO76074 875 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 UFL1O94874 794 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 PEX2P28328 305 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 PMLP29590 882 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 SSTR1P30872 391 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 SLC16A2P36021 539 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 HADHAP40939 763 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 GARSP41250 739 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 HARS2P49590 506 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 EMP3P54852 163 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 ARHGAP8P85298 464 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 ROR1Q01973 937 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 KDSRQ06136 332 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 DPYSL3Q14195 570 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 MAPRE2Q15555 327 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 BBS9Q3SYG4 887 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 NADK2Q4G0N4 442 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 TMEM110Q86TL2 294 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 TTC7BQ86TV6 843 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 PGAM4Q8N0Y7 254 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 TTC39CQ8N584 583 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 RDH11Q8TC12 318 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 NLRP7Q8WX94 980 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 SLC7A3Q8WY07 619 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 KAT5Q92993 513 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 ISL2Q96A47 359 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 C11orf70Q9BRQ4 267 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 ZNF341Q9BYN7 854 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 SLC2A11Q9BYW1 496 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 CLIC5Q9NZA1 410 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 SLC8A2Q9UPR5 921 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 AP4B1Q9Y6B7 739 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 NUMBLQ9Y6R0 609 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 SIPA1L1O43166 1804 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 A0A087WXM4 84 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 A0A0B4J269 797 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 WDR91A4D1P6 747 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 A6NJR5 290 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 SFI1A8K8P3 1242 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 WDR64B1ANS9 1081 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 TXNDC9O14530 226 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 SIN3BO75182 1162 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 H6PDO95479 791 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 NDUFB10O96000 172 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 IFNB1P01574 187 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 ERBB2P04626 1255 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 CD58P19256 250 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 ACO1P21399 889 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 OSBPP22059 807 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 YWHABP31946 246 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 RPL22P35268 128 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 SERPINB5P36952 375 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 GRIA2P42262 883 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 INHBCP55103 352 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 DLG1Q12959 904 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 TUBB3Q13509 450 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 MFSD10Q14728 455 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 PDK2Q15119 407 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 NOMO1Q15155 1222 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 NDUFA5Q16718 116 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 ZNF394Q53GI3 561 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 GRAMD4Q6IC98 578 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 TTC30AQ86WT1 665 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 CNTD1Q8N815 330 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 RDH13Q8NBN7 331 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 SLC4A11Q8NBS3 891 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 GSTCDQ8NEC7 633 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-202ENST00000341403 ACTL9Q8TC94 416 aa9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms