RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 LRRC8DQ7L1W4 858 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 LRRC17Q8N6Y2 441 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 SHCBP1Q8NEM2 672 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 CDC26Q8NHZ8 85 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 APBB2Q92870 758 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 MLXQ9UH92 298 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 M0QX08 132 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 MYL3P08590 195 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 CCDC28AQ8IWP9 274 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 C11orf70Q9BRQ4 267 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 VTA1Q9NP79 307 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 PFDN2Q9UHV9 154 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 SAGE2PA6NJ88 616 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 ADSSP30520 456 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 PTENP60484 403 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 IL5RAQ01344 420 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 SLC9A4Q6AI14 798 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 UTS2BQ765I0 119 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 LXNQ9BS40 222 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 DGCR6LQ9BY27 220 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 IL1RL2Q9HB29 575 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 V9GYQ6 96 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 CYP11B2P19099 503 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 GP5P40197 560 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 RAP1GAPP47736 663 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 C18orf8Q96DM3 657 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 SIPA1Q96FS4 1042 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 RIT2Q99578 217 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 VPS4AQ9UN37 437 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 AHI1Q8N157 1196 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 APPL2Q8NEU8 664 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRO-201ENST00000281171 POTEMA6NI47 508 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 APOA4P06727 396 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ALADP13716 330 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 COMTP21964 271 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 GTF2H1P32780 548 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 VAC14Q08AM6 782 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF544Q6NX49 715 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FAR2Q96K12 515 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ARMCX1Q9P291 453 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SLCO1B7G3V0H7 640 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FAM20BO75063 409 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 RPA1P27694 616 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ITGA1P56199 1179 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 KCNQ4P56696 695 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 NRF1Q16656 503 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TTI2Q6NXR4 508 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 C4orf22Q6V702 233 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SATL1Q86VE3 508 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 UNC45BQ8IWX7 931 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TTC30BQ8N4P2 665 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FAM151AQ8WW52 585 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 RAB26Q9ULW5 256 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 EFCAB10A6NFE3 127 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PSMD11O00231 422 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 KLHL18O94889 574 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 IL6P05231 212 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 UCHL3P15374 230 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 LDHDQ86WU2 507 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 DHFR2Q86XF0 187 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PHC3Q8NDX5 983 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 HTRA1Q92743 480 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 HSPBP1Q9NZL4 362 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 NAMPTP43490 491 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF232Q9UNY5 417 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 UPP2O95045 317 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms