RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254976.6

SNAP25-201, Transcript of synaptosome associated protein 25, humanhuman

APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAP25, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25-201ENST00000254976 MTMR11A4FU01 709 aa13.41□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 OR6C75A6NL08 312 aa13.41□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 L1CAMP32004 1257 aa13.41□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 VPS41P49754 854 aa13.41□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 EPHB4P54760 987 aa13.41□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 USP46P62068 366 aa13.41□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 DEUP1Q05D60 604 aa13.41□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 PPP1R7Q15435 360 aa13.41□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 MAP9Q49MG5 647 aa13.41□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 BBS12Q6ZW61 710 aa13.41□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 ACTL9Q8TC94 416 aa13.41□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 BADQ92934 168 aa13.41□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 RAB17Q9H0T7 212 aa13.41□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 NMUR1Q9HB89 426 aa13.41□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 PNPLA8Q9NP80 782 aa13.41□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 STAP1Q9ULZ2 295 aa13.41□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 SPDYE4A6NLX3 237 aa13.4□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 ZBBXA8MT70 800 aa13.4□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 I6L893 689 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 MDM4O15151 490 aa13.4□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 MAP3K6O95382 1288 aa13.4□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 ETS1P14921 441 aa13.4□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa13.4□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 ANKS3Q6ZW76 656 aa13.4□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 SCD5Q86SK9 330 aa13.4□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 PQLC3Q8N755 202 aa13.4□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 ATL2Q8NHH9 583 aa13.4□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 PCDH19Q8TAB3 1148 aa13.4□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 LRRN4Q8WUT4 740 aa13.4□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 RNF157Q96PX1 679 aa13.4□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 IL23AQ9NPF7 189 aa13.4□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 GRHL1Q9NZI5 618 aa13.4□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 RASAL2Q9UJF2 1139 aa13.4□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 FZD10Q9ULW2 581 aa13.4□□□□□ -0.26
SNAP25-201ENST00000254976 MAP2K7O14733 419 aa13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 RDXP35241 583 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 DUSP4Q13115 394 aa13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 GPR17Q13304 367 aa13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 MTMR3Q13615 1198 aa13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 CUL1Q13616 776 aa13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 PDK2Q15119 407 aa13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 MGAT5BQ3V5L5 792 aa13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 C1orf228Q6PIY5 440 aa13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 ZNF365Q70YC5 407 aa13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 HDXQ7Z353 690 aa13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 FBXO22Q8NEZ5 403 aa13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 IRGQQ8WZA9 623 aa13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 SLCO2A1Q92959 643 aa13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 TMEM121Q9BTD3 319 aa13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 HOMER3Q9NSC5 361 aa13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 DDIT4Q9NX09 232 aa13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 OSER1Q9NX31 292 aa13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 ZNF148Q9UQR1 794 aa13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 EFR3BQ9Y2G0 817 aa13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 NEU2Q9Y3R4 380 aa13.4□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 NUP205Q92621 2012 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 A0A1W2PQH9 124 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 WDR27A2RRH5 827 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 H7C4K7 107 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 OR1D2P34982 312 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 PLTPP55058 493 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 OASLQ15646 514 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 PSMD5Q16401 504 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 DPYSL2Q16555 572 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 USP41Q3LFD5 358 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 VSTM1Q6UX27 236 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 ZDHHC24Q6UX98 284 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 TAC4Q86UU9 113 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 NUP93Q8N1F7 819 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 SLC39A11Q8N1S5 342 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 CCDC33Q8N5R6 958 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 SLC35B2Q8TB61 432 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 AUTS2Q8WXX7 1259 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 ZNF558Q96NG5 402 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 RUNDC3BQ96NL0 473 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 YME1L1Q96TA2 773 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 FAM204AQ9H8W3 233 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 FAM114A2Q9NRY5 505 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 ASIC3Q9UHC3 531 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa13.39□□□□□ -0.27
SNAP25-201ENST00000254976 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.8 ms