RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 MSRAQ9UJ68 235 aa20.86■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 SCINQ9Y6U3 715 aa20.86■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 ADAM12O43184 909 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 ECEL1O95672 775 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 LSM8O95777 96 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 NUDT17P0C025 328 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 CPB1P15086 417 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 KRT71Q3SY84 523 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 C11orf70Q9BRQ4 267 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 ZBP1Q9H171 429 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 STK39Q9UEW8 545 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 C5orf67F2Z3F1 127 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 TULP2O00295 520 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 HPDP32754 393 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 LSP1P33241 339 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 MAN1A1P33908 653 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 GUCY1A3Q02108 690 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 PDE4CQ08493 712 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 DENND2CQ68D51 928 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 FAM35AQ86V20 835 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 HOOK3Q86VS8 718 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 DUSP16Q9BY84 665 aa20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 PSTPIP1O43586 416 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 BEST1O76090 585 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 RB1P06400 928 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 BDNFP23560 247 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 OR1D2P34982 312 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 CA8P35219 290 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 CCT5P48643 541 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 BCAT1P54687 386 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 ERVK-21P61565 698 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 RAB30Q15771 203 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 C2CD6Q53TS8 623 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 TMC7Q7Z402 723 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 POF1BQ8WVV4 589 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 ART4Q93070 314 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 SAMD11Q96NU1 681 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 PGLYRP2Q96PD5 576 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 EPB41L4BQ9H329 900 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 CERS4Q9HA82 394 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 KRT82Q9NSB4 513 aa20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 AP1G2O75843 785 aa20.83■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 CSPG5O95196 566 aa20.83■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 CTSAP10619 480 aa20.83■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 DNAJB1P25685 340 aa20.83■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 ERVFC1P60507 584 aa20.83■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 BST2Q10589 180 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 GPR17Q13304 367 aa20.83■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 MAMLD1Q13495 774 aa20.83■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 PPP1R7Q15435 360 aa20.83■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 SLC8B1Q6J4K2 584 aa20.83■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.83■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.83■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 CLEC20AQ6ZU45 233 aa20.83■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 SLC35F5Q8WV83 523 aa20.83■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 EPN3Q9H201 632 aa20.83■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 LZTS1Q9Y250 596 aa20.83■□□□□ 0.93
CLN8-208ENST00000635751 EBAG9O00559 213 aa20.83■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 LILRB3O75022 631 aa20.83■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 CXCL14O95715 111 aa20.83■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 FAM200BP0CF97 657 aa20.83■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 NPR3P17342 541 aa20.83■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 KCNJ1P48048 391 aa20.83■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 CACNA2D1P54289 1103 aa20.83■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 MAP3K7CLP57077 242 aa20.83■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 ROR1Q01973 937 aa20.83■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 SLMAPQ14BN4 828 aa20.83■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 PMF1Q6P1K2 205 aa20.83■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.83■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 ERICH1Q86X53 443 aa20.83■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.83■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 SMARCD1Q96GM5 515 aa20.83■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 PRO3102Q9H379 93 aa20.83■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 TMEM30AQ9NV96 361 aa20.83■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 WDR27A2RRH5 827 aa20.82■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 GRM6O15303 877 aa20.82■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 CYP2F1P24903 491 aa20.82■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 RGS7P49802 495 aa20.82■□□□□ 0.92
CLN8-208ENST00000635751 CALCOCO2Q13137 446 aa20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms