RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 PJA2O43164 708 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 NCK2O43639 380 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TIPRLO75663 272 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SLPIP03973 132 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 RAP2BP61225 183 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 NHLH2Q02577 135 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 FHL2Q14192 279 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 CSRP2Q16527 193 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TXNRD1Q16881 649 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SLC45A4Q5BKX6 768 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 DGKKQ5KSL6 1271 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 RNF220Q5VTB9 566 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 AFMIDQ63HM1 303 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TBC1D9BQ66K14 1250 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 HAS1Q92839 578 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SIL1Q9H173 461 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 GPR108Q9NPR9 543 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 QSER1Q2KHR3 1735 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TTC41PQ6P2S7 1318 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SH3TC1Q8TE82 1336 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SPEF2Q9C093 1822 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ARAP2Q8WZ64 1704 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 NRXN2Q9P2S2 1712 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 RIC1Q4ADV7 1423 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 GLULP15104 373 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 IL15P40933 162 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 RAD52P43351 418 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 PTTG1IPP53801 180 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TFCP2Q12800 502 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SEPT2Q15019 361 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 LRRC24Q50LG9 513 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 FAM209BQ5JX69 171 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SPATA1Q5VX52 437 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 GDF7Q7Z4P5 450 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SYT12Q8IV01 421 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 VGLL2Q8N8G2 317 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 CCHCR1Q8TD31 782 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 NRG4Q8WWG1 115 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 RSPH1Q8WYR4 309 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 C7orf25Q9BPX7 421 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 B3GNT5Q9BYG0 378 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 AREL1O15033 823 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 NDUFS2O75306 463 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 UBXN7O94888 489 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 GYS1P13807 737 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ATP5JP18859 108 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 OAS2P29728 719 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TM4SF1P30408 202 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 GUCY1A2P33402 732 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 MAPK10P53779 464 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 NPNTQ6UXI9 565 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 C4orf50Q6ZRC1 276 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 AACSQ86V21 672 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 DENND1CQ8IV53 801 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 KRT78Q8N1N4 520 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 DPF2Q92785 391 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 MRI1Q9BV20 369 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 MRIQ9BWK5 157 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SLC46A2Q9BY10 475 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 NUP62CLQ9H1M0 184 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 MANSC1Q9H8J5 431 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ECHDC1Q9NTX5 307 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 GGA3Q9NZ52 723 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SERPINB13Q9UIV8 391 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SIK3Q9Y2K2 1263 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TTLL3Q9Y4R7 772 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ATRNL1Q5VV63 1379 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ABCC12Q96J65 1359 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF609O15014 1411 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 AHRRA9YTQ3 701 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 DIRC3C9JPN6 131 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 H3BML4 177 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 B3GALT2O43825 422 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 INMTO95050 263 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 DHRS4L1P0CG22 281 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PDCP20941 246 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 C5AR1P21730 350 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 NR4A1P22736 598 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 KRT20P35900 424 aa4.65□□□□□ -1.67
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