RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521220.1

CCDC25-208, Transcript of coiled-coil domain containing 25, human

TSL 2

Gene CCDC25, Length 613 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC25-208	ENST00000521220		Q6ZTC4	211 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	MMP21	Q8N119	569 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	LACTBL1	A8MY62	500 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	CTAGE5	O15320	804 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	COQ9	O75208	318 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	VCAM1	P19320	739 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	EPHA3	P29320	983 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	PEX19	P40855	299 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	CD151	P48509	253 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	MTHFS	P49914	203 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	MTX1	Q13505	466 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	ICK	Q9UPZ9	632 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	IL33	O95760	270 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	ZNF853	P0CG23	659 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	TACR3	P29371	465 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	CFHR3	Q02985	330 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	EXOC5	O00471	708 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	MCM5	P33992	734 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	ARFIP2	P53365	341 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	RIPK4	P57078	832 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	RAB1A	P62820	205 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	RHD	Q02161	417 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	NME8	Q8N427	588 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	TIGD1	Q96MW7	591 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	SPRY2	O43597	315 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	CREB1	P16220	341 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	TIRAP	P58753	221 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	ZXDB	P98169	803 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.19	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	FGL2	Q14314	439 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CCDC25-208	ENST00000521220	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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