RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 NDC80O14777 642 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 MAP2K2P36507 400 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 BCAR1P56945 870 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 ROR1Q01973 937 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 TUBB8Q3ZCM7 444 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 CEP128Q6ZU80 1094 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 PCGF5Q86SE9 256 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 PQLC3Q8N755 202 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 PGM2Q96G03 612 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 C9orf72Q96LT7 481 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 SMOQ99835 787 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF670Q9BS34 389 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 MAGEB5Q9BZ81 275 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 RGS18Q9NS28 235 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 NINJ2Q9NZG7 142 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 AP4E1Q9UPM8 1137 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 H7C0C1 242 aa18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 STIP1P31948 543 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 L1CAMP32004 1257 aa18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 NOS2P35228 1153 aa18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 RPL22P35268 128 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 ATP5OP48047 213 aa18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 PPARDQ03181 441 aa18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 DPYSL2Q16555 572 aa18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 CCDC185Q8N715 623 aa18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 SLAIN1Q8ND83 568 aa18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM109Q9BVC6 243 aa18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 ULBP1Q9BZM6 244 aa18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 TGM2P21980 687 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 YY1P25490 414 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 GRK4P32298 578 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 MAGEA4P43358 317 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 GUCY1A3Q02108 690 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 MBTPS1Q14703 1052 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 LONRF1Q17RB8 773 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 CD300LGQ6UXG3 332 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC24A5Q71RS6 500 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM131BQ86XD5 332 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 VSIG1Q86XK7 387 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 RELL1Q8IUW5 271 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 UROC1Q96N76 676 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 RTP3Q9BQQ7 232 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 ACBD6Q9BR61 282 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 SAYSD1Q9NPB0 183 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 COX16Q9P0S2 106 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 CAPN9O14815 690 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 DAB1O75553 588 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 CYP2F1P24903 491 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 RDXP35241 583 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 VEGFBP49765 207 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 CACNA2D1P54289 1103 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 PPP2R2AP63151 447 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC9A4Q6AI14 798 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 TRAF7Q6Q0C0 670 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 RSPH1Q8WYR4 309 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 TLCD1Q96CP7 247 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 SMARCD1Q96GM5 515 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 POPDC2Q9HBU9 364 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 DSEQ9UL01 958 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 STAP1Q9ULZ2 295 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 C9IYK1 514 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 GOLGA8MH3BSY2 632 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 M0QYT0 321 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 NRP1O14786 923 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 FKTNO75072 461 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 MAP3K6O95382 1288 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 EOMESO95936 686 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 ITGB1P05556 798 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 MDH1P40925 334 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 NRLP54845 237 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 ARHGEF6Q15052 776 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 SYPL2Q5VXT5 272 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 GLB1LQ6UWU2 654 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 LRRC31Q6UY01 552 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 HFE2Q6ZVN8 426 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC43A3Q8NBI5 491 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 ZMIZ2Q8NF64 920 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 MYLPFQ96A32 169 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM30AQ9NV96 361 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 SHOC2Q9UQ13 582 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 M0QZQ0 153 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 ARVCFO00192 962 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 FBXO21O94952 628 aa18.22■□□□□ 0.51
TSNARE1-204ENST00000519651 CYP11A1P05108 521 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms