RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 WBP2Q969T9 261 aa26.02■■□□□ 1.76
ALYREF-203ENST00000511412 EEF2KMTQ96G04 330 aa26.02■■□□□ 1.76
ALYREF-203ENST00000511412 SMOC1Q9H4F8 434 aa26.02■■□□□ 1.76
ALYREF-203ENST00000511412 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
ALYREF-203ENST00000511412 CETN3O15182 167 aa26.01■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 STX10O60499 249 aa26.01■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 TBX18O95935 607 aa26.01■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
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ALYREF-203ENST00000511412 ZNF394Q53GI3 561 aa26.01■■□□□ 1.75
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ALYREF-203ENST00000511412 TMEM92Q6UXU6 159 aa26.01■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 SDK1Q7Z5N4 2213 aa26.01■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 NAT16Q8N8M0 369 aa26.01■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 FAXDC2Q96IV6 333 aa26.01■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
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ALYREF-203ENST00000511412 TULP3O75386 442 aa26■■□□□ 1.75
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ALYREF-203ENST00000511412 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
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ALYREF-203ENST00000511412 HTR3DQ70Z44 454 aa26■■□□□ 1.75
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ALYREF-203ENST00000511412 RXFP3Q9NSD7 469 aa26■■□□□ 1.75
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ALYREF-203ENST00000511412 RARGP13631 454 aa25.99■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
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ALYREF-203ENST00000511412 KLHDC10Q6PID8 442 aa25.99■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 NUDT18Q6ZVK8 323 aa25.99■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
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ALYREF-203ENST00000511412 DUSP16Q9BY84 665 aa25.99■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa25.99■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 RAB20Q9NX57 234 aa25.99■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.98■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 GREM1O60565 184 aa25.98■■□□□ 1.75
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ALYREF-203ENST00000511412 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 C10orf76Q5T2E6 689 aa25.98■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC186Q7Z3E2 898 aa25.98■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
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ALYREF-203ENST00000511412 TSG101Q99816 390 aa25.98■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 CISHQ9NSE2 258 aa25.98■■□□□ 1.75
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ALYREF-203ENST00000511412 MDM4O15151 490 aa25.97■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
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ALYREF-203ENST00000511412 BCKDHBP21953 392 aa25.97■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 PRCPP42785 496 aa25.97■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 PSEN1P49768 467 aa25.97■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 COBLL1Q53SF7 1204 aa25.97■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 C10orf120Q5SQS8 335 aa25.97■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 TCERG1LQ5VWI1 586 aa25.97■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 TCEAL6Q6IPX3 200 aa25.97■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 OLIG1Q8TAK6 271 aa25.97■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 KCNV2Q8TDN2 545 aa25.97■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 TCEAL3Q969E4 200 aa25.97■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 SPACA7Q96KW9 195 aa25.97■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
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ALYREF-203ENST00000511412 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa25.96■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 ADAM23O75077 832 aa25.96■■□□□ 1.75
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ALYREF-203ENST00000511412 KCNA4P22459 653 aa25.96■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 STPG1Q5TH74 334 aa25.96■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 GRAMD4Q6IC98 578 aa25.96■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 TPGS1Q6ZTW0 290 aa25.96■■□□□ 1.75
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ALYREF-203ENST00000511412 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 ARID3AQ99856 593 aa25.96■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 BBS2Q9BXC9 721 aa25.96■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
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ALYREF-203ENST00000511412 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 USP3Q9Y6I4 520 aa25.96■■□□□ 1.75
ALYREF-203ENST00000511412 NUP205Q92621 2012 aa25.96■■□□□ 1.75
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